RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320393.8

BCKDHB-201, Transcript of branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BCKDHB, Length 3,692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHB-201ENST00000320393 TRPA1O75762 1119 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 ASMTLO95671 621 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 CD48P09326 243 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 ALDH1B1P30837 517 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 ELK3P41970 407 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 BPIFB4P59827 614 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 LMNB2Q03252 620 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 SPP2Q13103 211 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 NCOA4Q13772 614 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 FNBP1LQ5T0N5 605 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 CD101Q93033 1021 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 SYT11Q9BT88 431 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 PARVAQ9NVD7 372 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 DOCK2Q92608 1830 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 FCHO1O14526 889 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 ATP5HO75947 161 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 IVDP26440 423 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 CDH8P55286 799 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 IGBP1P78318 339 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 KRT81Q14533 505 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 CHI3L2Q15782 390 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 GALNTL6Q49A17 601 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 OLIG1Q8TAK6 271 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 SPATA18Q8TC71 538 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 PYDC1Q8WXC3 89 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 H0YIN7 160 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 MCF2LO15068 1137 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 AMPD1P23109 780 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 VHLP40337 213 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 RGS7P49802 495 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 MMRN1Q13201 1228 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 RASA2Q15283 850 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 TAF5Q15542 800 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 MSS51Q4VC12 460 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 ACSBG2Q5FVE4 666 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 GMCL1Q96IK5 515 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.54□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 FGFR1P11362 822 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 C16orf46Q6P387 395 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 PODNQ7Z5L7 613 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 NUDCD3Q8IVD9 361 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 HACE1Q8IYU2 909 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 NMUR2Q9GZQ4 415 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 DCLRE1BQ9H816 532 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 LIASO43766 372 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 SLC1A1P43005 524 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 CDH6P55285 790 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 WNT7BP56706 349 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 CUL2Q13617 745 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 PDK4Q16654 411 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 RINLQ6ZS11 566 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 UBA3Q8TBC4 463 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 MBOAT7Q96N66 472 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 CEP41Q9BYV8 373 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 IP6K2Q9UHH9 426 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 RNF8O76064 485 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 AQP5P55064 265 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 NLRP4Q96MN2 994 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.53□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 KBTBD13C9JR72 458 aa14.52□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 KRT3P12035 628 aa14.52□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 IL31Q6EBC2 164 aa14.52□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 ANO5Q75V66 913 aa14.52□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 RNF148Q8N7C7 305 aa14.52□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 TRIM11Q96F44 468 aa14.52□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 SCINQ9Y6U3 715 aa14.52□□□□□ -0.08
BCKDHB-201ENST00000320393 TBX10O75333 385 aa14.52□□□□□ -0.09
BCKDHB-201ENST00000320393 CCNE2O96020 404 aa14.52□□□□□ -0.09
BCKDHB-201ENST00000320393 ABCG1P45844 678 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms