RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ACVR2BQ13705 512 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ZACNQ401N2 412 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 OTUD5Q96G74 571 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 SNF8Q96H20 258 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 PORCNQ9H237 461 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 GINM1Q9NU53 330 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 WHRNQ9P202 907 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 T-ENOLP0DO92 83 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 FDX1P10109 184 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 TCF4P15884 667 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 RANBP1P43487 201 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 STRN3Q13033 797 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 DNAJC3Q13217 504 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 COPS5Q92905 334 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 FAM136AQ96C01 138 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 PPP1R16BQ96T49 567 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 VCXQ9H320 206 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ELP3Q9H9T3 547 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ANAPC5Q9UJX4 755 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 SMAPO00193 183 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 PMM2O15305 246 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 NVLO15381 856 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 GARTP22102 1010 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 RCN2Q14257 317 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 WDR90Q96KV7 1748 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ITIH2P19823 946 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 MAPK4P31152 587 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 MCOLN2Q8IZK6 566 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 NINJ2Q9NZG7 142 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 SPAG7O75391 227 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ATF2P15336 505 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 CD58P19256 250 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 CUL3Q13618 768 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 CMPK2Q5EBM0 449 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF333Q96JL9 665 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 FGD4Q96M96 766 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 USTQ9Y2C2 406 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ATP2A1O14983 1001 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ATP5HO75947 161 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ACO1P21399 889 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 TMED2Q15363 201 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 RHBDF2Q6PJF5 856 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 LBX2Q6XYB7 198 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 MORC4Q8TE76 937 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ADAM33Q9BZ11 813 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 SCOCQ9UIL1 159 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 PTPRFP10586 1907 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ARL2P36404 184 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 PSMD6Q15008 389 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 LRRC8CQ8TDW0 803 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 RASA4BC9J798 803 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 FSCN2O14926 492 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 RASA4O43374 803 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 GCNT1Q02742 428 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC6Q16204 474 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 Q3C1V9 767 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 IRGCQ6NXR0 463 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 IFT43Q96FT9 208 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 PLVAPQ9BX97 442 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms