RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC142Q17RM4 750 aa20.6■□□□□ 0.89
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SPNS1-201ENST00000311008 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-201ENST00000311008 DENND1BQ6P3S1 775 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM50Q86XT4 487 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-201ENST00000311008 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-201ENST00000311008 NLRP4Q96MN2 994 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-201ENST00000311008 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-201ENST00000311008 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-201ENST00000311008 ALOX15BO15296 676 aa20.59■□□□□ 0.89
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SPNS1-201ENST00000311008 SLC18A1P54219 525 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-201ENST00000311008 PLCB3Q01970 1234 aa20.59■□□□□ 0.89
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SPNS1-201ENST00000311008 KCTD2Q14681 263 aa20.59■□□□□ 0.89
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SPNS1-201ENST00000311008 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.59■□□□□ 0.89
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SPNS1-201ENST00000311008 TBK1Q9UHD2 729 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-201ENST00000311008 SLC12A4Q9UP95 1085 aa20.59■□□□□ 0.89
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SPNS1-201ENST00000311008 RASA4O43374 803 aa20.59■□□□□ 0.89
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SPNS1-201ENST00000311008 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.59■□□□□ 0.89
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SPNS1-201ENST00000311008 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.58■□□□□ 0.89
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SPNS1-201ENST00000311008 TAZQ16635 292 aa20.58■□□□□ 0.89
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SPNS1-201ENST00000311008 P4HA1P13674 534 aa20.58■□□□□ 0.88
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SPNS1-201ENST00000311008 RAD23BP54727 409 aa20.58■□□□□ 0.88
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SPNS1-201ENST00000311008 BBS12Q6ZW61 710 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 MMP19Q99542 508 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
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SPNS1-201ENST00000311008 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.58■□□□□ 0.88
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SPNS1-201ENST00000311008 LRCH4O75427 683 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 PGK2P07205 417 aa20.57■□□□□ 0.88
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SPNS1-201ENST00000311008 MCF2P10911 925 aa20.57■□□□□ 0.88
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SPNS1-201ENST00000311008 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 MROH8Q9H579 483 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 ASB7Q9H672 318 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 SIX4Q9UIU6 781 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
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