RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299608.6

TMX3-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX3, Length 4,927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-201ENST00000299608 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 SLC12A8A0AV02 714 aa11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 CYP11B1P15538 503 aa11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 ARHGAP18Q8N392 663 aa11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 AGXT2Q9BYV1 514 aa11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 TXLNGQ9NUQ3 528 aa11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 PLAGL2Q9UPG8 496 aa11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 HPSEQ9Y251 543 aa11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 ZNF263O14978 683 aa11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 SMIM24O75264 130 aa11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 MYL4P12829 197 aa11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 VSNL1P62760 191 aa11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 PTK2BQ14289 1009 aa11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 USP10Q14694 798 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 CENPPQ6IPU0 288 aa11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 ORC6Q9Y5N6 252 aa11.15□□□□□ -0.62
TMX3-201ENST00000299608 PHF2O75151 1096 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 TMCC1O94876 653 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 LGALS2P05162 132 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 SLC2A3P11169 496 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 EVX2Q03828 476 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 FAM171A1Q5VUB5 890 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 DDI1Q8WTU0 396 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 MRIQ9BWK5 157 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 ARHGAP23Q9P227 1491 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 FAM47DPA6NHR8 397 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 RRM1P23921 792 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 NOGQ13253 232 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 VSIG10LQ86VR7 867 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 PPP1R36Q96LQ0 422 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 CIPCQ9C0C6 399 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 SMPD4Q9NXE4 827 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 CYP39A1Q9NYL5 469 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 KIAA1257Q9ULG3 409 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 IQGAP1P46940 1657 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 A0A1W2PQJ5 194 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 ASS1P00966 412 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 BCAT1P54687 386 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 SLC27A1Q6PCB7 646 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 RIOX2Q8IUF8 465 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 TMC2Q8TDI7 906 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 SERPINI1Q99574 410 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 ADAM2Q99965 735 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 SMYD3Q9H7B4 428 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 PAK5Q9P286 719 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 F5H5T6 163 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.639e-6■□□□□ 10.5
TMX3-201ENST00000299608 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 MTHFD1LQ6UB35 978 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 WDR49Q8IV35 697 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 TATDN2Q93075 761 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 PNMA5Q96PV4 448 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa11.14□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 ANKRD65E5RJM6 399 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 PTGER2P43116 358 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 VCPP55072 806 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 RBBP7Q16576 425 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 NLGN2Q8NFZ4 835 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 EDEM1Q92611 657 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 SLC5A5Q92911 643 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 GBP5Q96PP8 586 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 GAD1Q99259 594 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 SYT15Q9BQS2 421 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 KCNF1Q9H3M0 494 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 COG4Q9H9E3 785 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 L3MBTL1Q9Y468 752 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 ACKR2O00590 384 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 LHX1P48742 406 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 E2F5Q15329 346 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 KYNUQ16719 465 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 DNAAF5Q86Y56 855 aa11.13□□□□□ -0.63
TMX3-201ENST00000299608 JAMLQ86YT9 394 aa11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms