RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 GPC5P78333 572 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF569Q5MCW4 686 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP17Q68EM7 881 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 DENND1BQ6P3S1 775 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF365Q70YC5 407 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 RFFLQ8WZ73 363 aa21.99■■□□□ 1.11
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PACSIN3-201ENST00000298838 MYBL1P10243 752 aa21.98■■□□□ 1.11
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PACSIN3-201ENST00000298838 SYT10Q6XYQ8 523 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 MON1BQ7L1V2 547 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
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PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 VCPIP1Q96JH7 1222 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ALS2CR12Q96Q35 445 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 HESX1Q9UBX0 185 aa21.98■■□□□ 1.11
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PACSIN3-201ENST00000298838 BUB1O43683 1085 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 SYN1P17600 705 aa21.97■■□□□ 1.11
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PACSIN3-201ENST00000298838 OVOS1Q6IE37 1185 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM58Q8NG06 486 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ABHD8Q96I13 439 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 SYT15Q9BQS2 421 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 MARCH5Q9NX47 278 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAI1Q9UI46 699 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 CDH9Q9ULB4 789 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 MOCS3O95396 460 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 MMP8P22894 467 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 NOP2P46087 812 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 BCAR1P56945 870 aa21.96■■□□□ 1.11
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PACSIN3-201ENST00000298838 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 RHOT2Q8IXI1 618 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF592Q92610 1267 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR24Q96S15 920 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.96■■□□□ 1.11
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PACSIN3-201ENST00000298838 SYN3O14994 580 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP2C2O75185 946 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC130P13994 396 aa21.96■■□□□ 1.11
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PACSIN3-201ENST00000298838 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 LPIN3Q9BQK8 851 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ACBD6Q9BR61 282 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 CWH43Q9H720 699 aa21.96■■□□□ 1.11
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PACSIN3-201ENST00000298838 CALB1P05937 261 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 PBX3P40426 434 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 GPD2P43304 727 aa21.95■■□□□ 1.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM240Q5SV17 173 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 LIN9Q5TKA1 542 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA0319Q5VV43 1072 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 ERICH1Q86X53 443 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC35F6Q8N357 371 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 UBA3Q8TBC4 463 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC35G2Q8TBE7 412 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC2A14Q8TDB8 520 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 YME1L1Q96TA2 773 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa21.95■■□□□ 1.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 KIF18AQ8NI77 898 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.12e-9■□□□□ 9.1
PACSIN3-201ENST00000298838 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 VWA8A3KMH1 1905 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 SETSIPP0DME0 302 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 BCAT1P54687 386 aa21.94■■□□□ 1.1
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