RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 ZBED8Q8IZ13 594 aa29.48■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 TXLNGQ9NUQ3 528 aa29.48■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 SGK1O00141 431 aa29.48■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 FAM189A1O60320 539 aa29.48■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 SPAG7O75391 227 aa29.48■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 TOM1L1O75674 476 aa29.48■■■□□ 2.31
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UBP1-201ENST00000283628 UNC5CO95185 931 aa29.48■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 HARSP12081 509 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
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UBP1-201ENST00000283628 GPATCH11Q8N954 259 aa29.48■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 KRT16P08779 473 aa29.47■■■□□ 2.31
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UBP1-201ENST00000283628 MSH2P43246 934 aa29.46■■■□□ 2.31
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UBP1-201ENST00000283628 PLCB3Q01970 1234 aa29.46■■■□□ 2.31
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UBP1-201ENST00000283628 HOXC10Q9NYD6 342 aa29.46■■■□□ 2.31
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UBP1-201ENST00000283628 HIF1AQ16665 826 aa29.46■■■□□ 2.31
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UBP1-201ENST00000283628 WDTC1Q8N5D0 677 aa29.46■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 TTC13Q8NBP0 860 aa29.46■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 TMEM121Q9BTD3 319 aa29.46■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 PPME1Q9Y570 386 aa29.46■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 MAFO75444 373 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
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UBP1-201ENST00000283628 TNFSF9P41273 254 aa29.45■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 PDE4CQ08493 712 aa29.45■■■□□ 2.31
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UBP1-201ENST00000283628 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP29.45■■■□□ 2.31
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UBP1-201ENST00000283628 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
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UBP1-201ENST00000283628 CHST13Q8NET6 341 aa29.44■■■□□ 2.3
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UBP1-201ENST00000283628 ZWINTO95229 277 aa29.42■■■□□ 2.3
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UBP1-201ENST00000283628 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB33Q86T24 672 aa29.42■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 C4orf33Q8N1A6 199 aa29.42■■■□□ 2.3
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