RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 HOXC10Q9NYD6 342 aa11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 TAS2R1Q9NYW7 299 aa11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 CNTNAP1P78357 1384 aa11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 C10orf71Q711Q0 1435 aa11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 TISP43B9A030 160 aa11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 MYL2P10916 166 aa11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 AP2B1P63010 937 aa11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 OCRLQ01968 901 aa11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 MAPK6Q16659 721 aa11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 PLA2G4FQ68DD2 849 aa11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 RINLQ6ZS11 566 aa11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 KBTBD2Q8IY47 623 aa11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 MTBPQ96DY7 904 aa11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM117Q9H0C3 514 aa11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 CYP4F11Q9HBI6 524 aa11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 ATXN10Q9UBB4 475 aa11.37□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 NHSQ6T4R5 1651 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 ETS1P14921 441 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 OSBPP22059 807 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 AP1B1Q10567 949 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 FSTL1Q12841 308 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 NR1H3Q13133 447 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 C11orf63Q6NUN7 778 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SWSAP1Q6NVH7 229 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 ERO1BQ86YB8 467 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 CTAGE3PQ8IX95 158 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 NME8Q8N427 588 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SMC1BQ8NDV3 1235 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 TCP10LQ8TDR4 215 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 PTPRN2Q92932 1015 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 PCDHB18PQ96TA0 734 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SPATA16Q9BXB7 569 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 MANSC1Q9H8J5 431 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 PARVGQ9HBI0 331 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 IRS2Q9Y4H2 1338 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 TGFB1I1O43294 461 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 ARSEP51690 589 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 DLG4P78352 724 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 BBS9Q3SYG4 887 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 PALM2Q8IXS6 379 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 PYDC1Q8WXC3 89 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 FAM136AQ96C01 138 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 TEPSINQ96N21 525 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 APOL6Q9BWW8 343 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 FAM192AQ9GZU8 254 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 GINM1Q9NU53 330 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 USP54Q70EL1 1684 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SGK1O00141 431 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 OR6B1O95007 311 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 KRT10P13645 584 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 DYNLT1P63172 113 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SNAPC2Q13487 334 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 MOGSQ13724 837 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SH2D4BQ5SQS7 431 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SLFN12Q8IYM2 578 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 DCAF4Q8WV16 495 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 TIPINQ9BVW5 301 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 FEM1BQ9UK73 627 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 GRID1Q9ULK0 1009 aa11.36□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 ESYT2A0FGR8 921 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 K7ENM7 598 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 C2CD2LO14523 706 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 FCHO1O14526 889 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 MT-ND3P03897 115 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SSTR1P30872 391 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 ASPHQ12797 758 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 MTMR1Q13613 665 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM132BQ14DG7 1078 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 WDR72Q3MJ13 1102 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 MMEL1Q495T6 779 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 PASD1Q8IV76 773 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 MAP7D3Q8IWC1 876 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 PYROXD1Q8WU10 500 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 CPA5Q8WXQ8 436 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 OLFM3Q96PB7 478 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 FAM111AQ96PZ2 611 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 BGNP21810 368 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 MAN1A1P33908 653 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 MXI1P50539 228 aa11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms