RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250066.6

USP6-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP6, Length 7,976 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6-201ENST00000250066 IDH3BO43837 385 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 ZNF682O95780 498 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 LBPP18428 481 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 MSH3P20585 1137 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 ADORA2BP29275 332 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 CYP2C19P33261 490 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 VAMP7P51809 220 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 PTK6Q13882 451 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 PHF11Q9UIL8 331 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 MCM8Q9UJA3 840 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 KIAA0556O60303 1618 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 A2MP01023 1474 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 LOC100653049A0A140TA62 436 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 HEATR9A2RTY3 570 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 WWP2O00308 870 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 RAD23AP54725 363 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 GMFBP60983 142 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 GALNTL6Q49A17 601 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 ERMARDQ5T6L9 678 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 HAVCR1Q96D42 359 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 SERPINB12Q96P63 405 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 ABCC10Q5T3U5 1492 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 IFNA14P01570 189 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 NR3C1P04150 777 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 DSG3P32926 999 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 AP1S1P61966 158 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 TTLL9Q3SXZ7 439 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 CCDC185Q8N715 623 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 KLHL4Q9C0H6 718 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 WWOXQ9NZC7 414 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 NOS1P29475 1434 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 TIMM44O43615 452 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 OR6B1O95007 311 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 MMP1P03956 469 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 CHRM3P20309 590 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 GRK3P35626 688 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 SLC16A2P36021 539 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 ABATP80404 500 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 TAF5Q15542 800 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 FAM9CQ8IZT9 166 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 ARHGEF26Q96DR7 871 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 AMACRQ9UHK6 382 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 A0A087WWV3 80 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 ANO9A1A5B4 782 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 VWA5AO00534 786 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 CCDC157Q569K6 752 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 KRT35Q92764 455 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 FAM167AQ96KS9 214 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 CYLDQ9NQC7 956 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 CHKBQ9Y259 395 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 CITO14578 2027 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 MGAT4DA6NG13 374 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 IL5RAQ01344 420 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 PTK7Q13308 1070 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 TAF13Q15543 124 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 SLC9A6Q92581 669 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 PAGE5Q96GU1 130 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 CLCC1Q96S66 551 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa8.99□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 SOAT2O75908 522 aa8.98□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 CYP2D6P10635 497 aa8.98□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 SMCO1Q147U7 214 aa8.98□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa8.98□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.98□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 EPB41L4BQ9H329 900 aa8.98□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 DSN1Q9H410 356 aa8.98□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 BTG4Q9NY30 223 aa8.98□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 MAP10Q9P2G4 905 aa8.98□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.98□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 CCDC162PA2VCL2 907 aa8.98□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 G2E3Q7L622 706 aa8.98□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 SVOPQ8N4V2 548 aa8.98□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.98□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 COA7Q96BR5 231 aa8.98□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 MAGED4Q96JG8 741 aa8.98□□□□□ -0.97
USP6-201ENST00000250066 ZNF333Q96JL9 665 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms