RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 AIFM3Q96NN9 605 aa17.89■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 GCNAQ96QF7 691 aa17.89■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 HSFX1Q9UBD0 423 aa17.89■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 TNFSF13BQ9Y275 285 aa17.89■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP17.88■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 ATP2B1P20020 1258 aa17.88■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 AVPR1AP37288 418 aa17.88■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP17.88■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 BFSP1Q12934 665 aa17.88■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 MAP7D1Q3KQU3 841 aa17.88■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM92Q6UXU6 159 aa17.88■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM130Q8N3G9 435 aa17.88■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF843Q8N446 348 aa17.88■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC26Q8TAB7 109 aa17.88■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 PTPRHQ9HD43 1115 aa17.88■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 TDP1Q9NUW8 608 aa17.88■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 TCHHQ07283 1943 aa17.88■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 K7EQS6 105 aa17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP33O14559 1287 aa17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 MAP3K13O43283 966 aa17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 SLC14A1Q13336 389 aa17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 MYBPC2Q14324 1141 aa17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 C2orf27AQ580R0 203 aa17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 SLCO6A1Q86UG4 719 aa17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM22Q8IYM9 498 aa17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 MAB21L3Q8N8X9 362 aa17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 WHAMMQ8TF30 809 aa17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 SCN1AP35498 2009 aa17.87■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 DEXIO95424 95 aa17.86■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 NMT1P30419 496 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 EFNA5P52803 228 aa17.86■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 SEC13P55735 322 aa17.86■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 CCT2P78371 535 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
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SPCS1-201ENST00000233025 ZNF568Q3ZCX4 644 aa17.86■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 GLRX5Q86SX6 157 aa17.86■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 TTC30AQ86WT1 665 aa17.86■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 NAXDQ8IW45 347 aa17.86■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC33Q8N5R6 958 aa17.86■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 KCNJ14Q9UNX9 436 aa17.86■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa17.86■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 ALDH1A2O94788 518 aa17.85■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 REC8O95072 547 aa17.85■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 BAG4O95429 457 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa17.85■□□□□ 0.45
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SPCS1-201ENST00000233025 MTF1Q14872 753 aa17.85■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 VEPH1Q14D04 833 aa17.85■□□□□ 0.45
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SPCS1-201ENST00000233025 EML3Q32P44 896 aa17.85■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa17.85■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 OSCP1Q8WVF1 389 aa17.85■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 ACAP3Q96P50 834 aa17.85■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
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SPCS1-201ENST00000233025 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHA12Q9UN75 941 aa17.85■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 J3QKU1 62 aa17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 ABLIM1O14639 778 aa17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 CBFA2T3O75081 653 aa17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 F11P03951 625 aa17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 PSMA5P28066 241 aa17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 OPRD1P41143 372 aa17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 NLRP12P59046 1061 aa17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 CYP4F3Q08477 520 aa17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 NBR1Q14596 966 aa17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF77Q15935 545 aa17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 OVOS1Q6IE37 1185 aa17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 RABEPKQ7Z6M1 372 aa17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 USP37Q86T82 979 aa17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 ATP2A3Q93084 1043 aa17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 MYH11P35749 1972 aa17.84■□□□□ 0.45
SPCS1-201ENST00000233025 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
SPCS1-201ENST00000233025 CYP11B2P19099 503 aa17.83■□□□□ 0.44
SPCS1-201ENST00000233025 TYMPP19971 482 aa17.83■□□□□ 0.44
SPCS1-201ENST00000233025 PROZP22891 400 aa17.83■□□□□ 0.44
SPCS1-201ENST00000233025 USP4Q13107 963 aa17.83■□□□□ 0.44
SPCS1-201ENST00000233025 TXNDC8Q6A555 127 aa17.83■□□□□ 0.44
SPCS1-201ENST00000233025 PADI6Q6TGC4 694 aa17.83■□□□□ 0.44
SPCS1-201ENST00000233025 RUFY3Q7L099 469 aa17.83■□□□□ 0.44
SPCS1-201ENST00000233025 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa17.83■□□□□ 0.44
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