RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AXIN1O15169 862 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CHADO15335 359 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KLRC4O43908 158 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EPHA5P54756 1037 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SHC2P98077 582 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SAAL1Q96ER3 474 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UBE4BO95155 1302 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRR29P0C7W0 189 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CPB1P15086 417 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CYP3A5P20815 502 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZBTB6Q15916 424 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC6Q16204 474 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 JADE1Q6IE81 842 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TXNDC11Q6PKC3 985 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 WDR5BQ86VZ2 330 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TTC8Q8TAM2 541 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ASB7Q9H672 318 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MAFFQ9ULX9 164 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ANK1P16157 1881 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HOXA6P31267 233 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CTHP32929 405 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MCM4P33991 863 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HOXD13P35453 343 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PSMD2Q13200 908 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM132DQ14C87 1099 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 WDR44Q5JSH3 913 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 APPL2Q8NEU8 664 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BEST2Q8NFU1 509 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SUSD3Q96L08 255 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DERAQ9Y315 318 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 YIPF1Q9Y548 306 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 A0A1W2PRU2 124 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EXTL3O43909 919 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IL18RAPO95256 599 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NFICP08651 508 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF806P0C7X5 589 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LRPAP1P30533 357 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HOXC13P31276 330 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FCHO2Q0JRZ9 810 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PON2Q15165 354 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SPATA1Q5VX52 437 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPD1LQ8N335 351 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RXFP3Q9NSD7 469 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DPYSL4O14531 572 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TM4SF5O14894 197 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GUCY2FP51841 1108 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DPYDQ12882 1025 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 STK4Q13043 487 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 STPG1Q5TH74 334 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LOXL4Q96JB6 756 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C2CD2Q9Y426 696 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TGFB1I1O43294 461 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EPN2O95208 641 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PLD1Q13393 1074 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms