RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000100497.10

Actb-201, Transcript of Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Actb, Length 1,920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Axon, Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Dendrite, Endoplasmic reticulum, Exosome, Growth cone, Lamellipodium, Perinuclear, Ribosome, Somatodendritic compartment .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actb-201ENSMUST00000100497 AarsQ8BGQ7 968 aa12.9□□□□□ -0.34
Actb-201ENSMUST00000100497 Dus1lQ8C2P3 475 aa12.9□□□□□ -0.34
Actb-201ENSMUST00000100497 Kct2Q8K201 259 aa12.9□□□□□ -0.34
Actb-201ENSMUST00000100497 Epn3Q91W69 636 aa12.9□□□□□ -0.34
Actb-201ENSMUST00000100497 Me2Q99KE1 589 aa12.9□□□□□ -0.34
Actb-201ENSMUST00000100497 Katnbl1Q9CWJ3 299 aa12.9□□□□□ -0.34
Actb-201ENSMUST00000100497 Mgrn1Q9D074 532 aa12.9□□□□□ -0.34
Actb-201ENSMUST00000100497 Coro7Q9D2V7 922 aa12.9□□□□□ -0.34
Actb-201ENSMUST00000100497 Rsph3bQ9DA80 389 aa12.9□□□□□ -0.34
Actb-201ENSMUST00000100497 Cpne8Q9DC53 577 aa12.9□□□□□ -0.34
Actb-201ENSMUST00000100497 Rpl9-ps1S4R1R7 191 aa12.9□□□□□ -0.34
Actb-201ENSMUST00000100497 Tatdn2B7ZNL9 783 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm5795E9PZN8 263 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm3460E9QAI8 215 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Zfp850J3QPC5 689 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Chrna1P04756 457 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Zscan2Q07230 614 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 SobpQ0P5V2 864 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Samhd1Q60710 627 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Cln3Q61124 438 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Dpysl3Q62188 570 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Tfdp2Q64163 446 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Fcrl5Q68SN8 596 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Gpr151Q7TSN6 422 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 FtoQ8BGW1 502 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Enpp4Q8BTJ4 456 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Fam163bQ8BUM6 167 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Q8BZE1 841 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Syt15Q8C6N3 418 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Kat14Q8CID0 779 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Haus3Q8QZX2 570 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Trpm8Q8R4D5 1104 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Tti1Q91V83 1085 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Trpv6Q91WD2 767 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Trps1Q925H1 1281 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Elp3Q9CZX0 547 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Drc3Q9D5E4 523 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 MrgbpQ9DAT2 204 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Mettl7bQ9DD20 244 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Ddx24Q9ESV0 857 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Gtf2ird1Q9JI57 1104 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Trpm5Q9JJH7 1158 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Plagl1Q9JLQ4 704 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Gkap1Q9JMB0 366 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Nr1h3Q9Z0Y9 445 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Krt16Q9Z2K1 469 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Btbd19S4R1I0 287 aa12.9□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Ccdc24E9PUW8 296 aa12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Zfp94E9Q6Y4 486 aa12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Clcn6O35454 870 aa12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Ripply1Q2WG77 201 aa12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 CblbQ3TTA7 982 aa12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Nek10Q3UGM2 1111 aa12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Cyp3a16Q64481 504 aa12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Pxylp1Q8BHA9 480 aa12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Slc15a5Q8CBB2 566 aa12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 OafQ8QZR4 282 aa12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Setd3Q91WC0 594 aa12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Xpo6Q924Z6 1125 aa12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Pcyox1Q9CQF9 505 aa12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Wdr83Q9DAJ4 315 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Chst7Q9EP78 484 aa12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Hic1Q9R1Y5 733 aa12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Myo1cQ9WTI7 1063 aa12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Trpv2Q9WTR1 756 aa12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Krt27Q9Z320 448 aa12.89□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Fignl2J3QK54 644 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 NfkbieO54910 364 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 TxnP10639 105 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Eno1P17182 434 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 IppP28575 584 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Aimp1P31230 310 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Rbp3P49194 1234 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Hsd17b2P51658 381 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Usp10P52479 792 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 PhbP67778 272 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Msx3P70354 204 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Shox2P70390 331 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Oas1fQ14AZ4 364 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Cdca2Q14B71 982 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Lrriq3Q14DL3 633 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Pi4k2aQ2TBE6 479 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Spryd7Q3TFQ1 196 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Znf219Q6IQX8 726 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr23Q7TRX4 325 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Arhgap15Q811M1 481 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Rsl1d1Q8BVY0 452 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Kctd12bQ8C7J6 292 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Slc35f6Q8VE96 372 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Themis2Q91YX0 663 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Kdelr1Q99JH8 212 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Tspan17Q9D7W4 270 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Tmod3Q9JHJ0 352 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Prg3Q9JL95 222 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Trpc2Q9R244 1172 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Serpinb6cW4VSP4 379 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Tmem131O70472 1877 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Arrdc4A0A0B4J1F4 415 aa12.88□□□□□ -0.35
Actb-201ENSMUST00000100497 Mindy4b-psA0A1W2P7H6 457 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.2 ms