RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039559.8

Thbs1-201, Transcript of Thrombospondin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Thbs1, Length 5,848 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Trim12cD3Z3L3 497 aa9.7□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 C2cd2E9Q3C1 696 aa9.7□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 GclmO09172 274 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Igfbp4P47879 254 aa9.7□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ccna2P51943 422 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ptprn2P80560 1001 aa9.7□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Prr7Q3V0I2 269 aa9.7□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ksr1Q61097 873 aa9.7□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 SugctQ7TNE1 436 aa9.7□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ifi205aQ8CGE8 404 aa9.7□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Unc5bQ8K1S3 945 aa9.7□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pcyox1Q9CQF9 505 aa9.7□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CygbQ9CX80 190 aa9.7□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Timm50Q9D880 353 aa9.7□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pdzrn4E9PUZ9 1014 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rag1P15919 1040 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slc11a2P49282 568 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mcm9Q2KHI9 1134 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nr1h4Q60641 488 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vps50Q8CI71 964 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rpn2Q9DBG6 631 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tlr9Q9EQU3 1032 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ifi30Q9ESY9 248 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Git2Q9JLQ2 708 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Trpm1Q2TV84 1622 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PtprmP28828 1452 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fgf15O35622 218 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Scd1P13516 355 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Krt2Q3TTY5 707 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 XpaQ64267 272 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gcfc2Q8BKT3 769 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Phf20Q8BLG0 1010 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Epc2Q8C0I4 808 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Stx5Q8K1E0 355 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gprc5dQ9JIL6 344 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gyg1Q9R062 333 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rbck1Q9WUB0 508 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Arhgef28P97433 1693 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr726E9Q8X3 321 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm8926L7MUE8 181 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pgk2P09041 417 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hspa9P38647 679 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sat1P48026 171 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 ThraP63058 492 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Polr1bP70700 1135 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr725Q05A45 321 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ube3cQ80U95 1083 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 MyripQ8K3I4 856 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Clptm1Q8VBZ3 664 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 NclnQ8VCM8 563 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nr3c2Q8VII8 978 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Kcnh7Q9ER47 1195 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pkp3Q9QY23 797 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mapk13Q9Z1B7 366 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 JcadQ5DTX6 1320 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pramef20B1ARV6 477 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm8113E0CXS8 587 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Klf6O08584 283 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Foxm1O08696 760 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 AlbP07724 608 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Csn1s1P19228 313 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nedd1P33215 660 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mbl1P39039 239 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fgfr4Q03142 799 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 4933427I04RikQ3V053 235 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Afg1lQ3V384 480 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ddr2Q62371 854 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Prpf18Q8BM39 342 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pop1Q8K205 1045 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Prpf39Q8K2Z2 665 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Wrap53Q8VC51 532 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam49bQ921M7 324 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rpap3Q9D706 660 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cyp4f14Q9EP75 524 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Asah2Q9JHE3 756 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mst1rQ62190 1378 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Speer4cG3UXD1 256 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm8298J3QPI0 401 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm10354K7N6A0 256 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Xirp1O70373 1129 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Orm2P07361 207 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rbm20Q3UQS8 1199 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cep295nlQ497N6 533 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Capn11Q6J756 714 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Raver2Q7TPD6 673 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Q8BGN9 141 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dusp19Q8K4T5 220 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Taf6lQ8R2K4 616 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 AagabQ8R2R3 316 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Stx18Q8VDS8 334 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mlc1Q8VHK5 382 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Satb2Q8VI24 733 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Atpaf2Q91YY4 289 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Znf654Q9DAU9 571 aa9.69□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Scgb2b18A0A087WPA9 112 aa9.68□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 EloblA6PWE0 161 aa9.68□□□□□ -0.86
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cyp3a13Q64464 503 aa9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.4 ms