RNA–Protein interactions for RNA: YKR005C

YKR005C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR005C, Length 1,578 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR005CYKR005C QRI5P32344 111 aa8.56□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C SAS2P40963 338 aa8.56□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C TRI1Q05024 226 aa8.56□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C RFM1Q12192 310 aa8.56□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C HMRA1P0CY11 126 aa8.55□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C CUP2P15315 225 aa8.55□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C RAD23P32628 398 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C GON7P46984 123 aa8.55□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C PAU23Q07987 124 aa8.55□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C PAU17Q12370 124 aa8.55□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C DAL82P21705 255 aa8.54□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C YOX1P34161 385 aa8.54□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C PRE5P40302 234 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C YHP1Q04116 353 aa8.54□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C TVP18Q04767 167 aa8.54□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C CNL1Q06333 122 aa8.54□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C POS5Q06892 414 aa8.54□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C YBR090CP38253 122 aa8.53□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C YJL028WP47062 111 aa8.53□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C YMR166CQ03829 368 aa8.53□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C CSI2Q08054 341 aa8.53□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C TOR1P35169 2470 aa8.53□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C YER190C-BP0CX94 160 aa8.52□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C YEL077W-AP0CX95 160 aa8.52□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C YGR296C-BP0CX96 160 aa8.52□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C YPL283W-BP0CX97 160 aa8.52□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C YPR204C-AP0CX98 160 aa8.52□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C MIG1P27705 504 aa8.52□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C FPR2P32472 135 aa8.52□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C NNK1P36003 928 aa8.52□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C PMU1P36069 295 aa8.52□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C YHR173CP38864 112 aa8.52□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C TEM1P38987 245 aa8.52□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C YAR068WP39564 161 aa8.52□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C SIP18P50263 79 aa8.52□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C CWC27Q02770 301 aa8.52□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C YDL157CQ12082 118 aa8.52□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
YKR005CYKR005C HSP12P22943 109 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C ICS2P38284 255 aa8.52□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C DMA2P53924 522 aa8.52□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C ATP19P81451 68 aa8.52□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C YDR114CQ04597 100 aa8.52□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C YOS1Q3E834 85 aa8.52□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C YLR302CO13544 120 aa8.51□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C GSP1P32835 219 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C GSP2P32836 220 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C PIS1P06197 220 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C SEC4P07560 215 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C YFL054CP43549 646 aa8.5□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C SSU72P53538 206 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C YNR064CP53750 290 aa8.5□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data8.49□□□□□ -1.05not detected
YKR005CYKR005C TIR1P10863 254 aa8.49□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C YCR007CP25354 239 aa8.49□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C UTR5P32630 166 aa8.49□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C UME6P39001 836 aa8.49□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C TDA4P47153 279 aa8.49□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C YGR151CP53287 111 aa8.49□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C CSM4Q08955 156 aa8.49□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C RNH203Q12338 110 aa8.49□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C NOP1P15646 327 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C YGL118CP53132 145 aa8.48□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C COX18P53239 316 aa8.48□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C GIM5Q04493 163 aa8.48□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C NDE2Q07500 545 aa8.48□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C CSF1Q12150 2958 aa8.48□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C ZRT1P32804 376 aa8.48□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C RAV2Q03956 351 aa8.48□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C FIT2Q08906 153 aa8.48□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C YDL183CP48569 320 aa8.47□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C YPL162CQ12042 273 aa8.47□□□□□ -1.05
YKR005CYKR005C RPB10P22139 70 aa8.46□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C HAC1P41546 238 aa8.46□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C YJL118WP47022 219 aa8.46□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C YGL230CP53074 147 aa8.46□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa8.46□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C SEC72P39742 193 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C YDR366CP87287 132 aa8.45□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C RKI1Q12189 258 aa8.45□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C MTR2P34232 184 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C PIR5P46999 287 aa8.44□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C THG1P53215 237 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C YNR071CP53757 342 aa8.44□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C FMP27Q06179 2628 aa8.44□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C HEM4P06174 275 aa8.44□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C SEC11P15367 167 aa8.44□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C CSH1P38287 376 aa8.44□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C BDH1P39714 382 aa8.44□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C YER188WP40103 239 aa8.44□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C SDS23P53172 527 aa8.44□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C TOM7P53507 60 aa8.44□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C MRX11Q03079 207 aa8.44□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C TOR2P32600 2474 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C HTB1P02293 131 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
YKR005CYKR005C YBL071CP38185 102 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13 ms