RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641949.1

MFSD8-256, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

BASIC

Gene MFSD8, Length 1,640 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-256	ENST00000641949	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	7.85	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		7.85	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		7.85	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	COL4A6	Q14031	1691 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	BIN1	O00499	593 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	B4GALT3	O60512	393 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	DKK1	O94907	266 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	DNAJB1	P25685	340 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	PRCP	P42785	496 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	ERVFC1	P60507	584 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	SURF1	Q15526	300 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	UPP1	Q16831	310 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	JADE1	Q6IE81	842 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	BEST2	Q8NFU1	509 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	HASPIN	Q8TF76	798 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	FNBP1	Q96RU3	617 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	TLE6	Q9H808	572 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	DERA	Q9Y315	318 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
MFSD8-256	ENST00000641949	TRIO	O75962	3097 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	PODXL	O00592	558 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	PSMA7	O14818	248 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	NCK2	O43639	380 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	NR3C1	P04150	777 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	ADRB2	P07550	413 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	TNNI1	P19237	187 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	CYP3A5	P20815	502 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	PPP1R2	P41236	205 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	ADAM9	Q13443	819 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	CAMK1	Q14012	370 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	NAB2	Q15742	525 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	ZBTB6	Q15916	424 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	USP41	Q3LFD5	358 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	CEP135	Q66GS9	1140 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	USP37	Q86T82	979 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	CEP57	Q86XR8	500 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	TRIM11	Q96F44	468 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	TSG101	Q99816	390 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	IGFLR1	Q9H665	355 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	DPP3	Q9NY33	737 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	C2CD2	Q9Y426	696 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	MYO7A	Q13402	2215 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	SERTM1	A2A2V5	107 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949		F8W810	466 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	PER2	O15055	1255 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	7.82	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	ATP9B	O43861	1147 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	KIF4A	O95239	1232 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	MBD3	O95983	291 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	SOD2	P04179	222 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	UROD	P06132	367 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	NFIC	P08651	508 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	CTSA	P10619	480 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	NR2F2	P24468	414 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	7.82	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	MYBPC2	Q14324	1141 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MFSD8-256	ENST00000641949	SPATA1	Q5VX52	437 aa		7.82	□□□□□ -1.16

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