RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	CISH	Q9NSE2	258 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	KRT34	O76011	436 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	KRT37	O76014	449 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	PTGIR	P43119	386 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	CCNG2	Q16589	344 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	VPS11	Q9H270	941 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	TJP1	Q07157	1748 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	KRT7	P08729	469 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	ADSS	P30520	456 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	NRL	P54845	237 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	GTF2B	Q00403	316 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	ROR1	Q01973	937 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	NETO2	Q8NC67	525 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	ALS2	Q96Q42	1657 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	PIK3CD	O00329	1044 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	MED7	O43513	233 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	GJB1	P08034	283 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	CLCN3	P51790	818 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	KCTD2	Q14681	263 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	LPAR1	Q92633	364 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	SLIT2	O94813	1529 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525		H3BRJ5	948 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	PDGFRB	P09619	1106 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	DSG3	P32926	999 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	TNFSF9	P41273	254 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	NR1H3	Q13133	447 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	GEN1	Q17RS7	908 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	FITM2	Q8N6M3	262 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	MAGEB18	Q96M61	343 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	PAFAH2	Q99487	392 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	DMAC2	Q9NW81	257 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	YDJC	A8MPS7	323 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	PGK2	P07205	417 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	CCND1	P24385	295 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	ADORA2B	P29275	332 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	CENPC	Q03188	943 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	MAMLD1	Q13495	774 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	LRRC6	Q86X45	466 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	C3orf20	Q8ND61	904 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	SCYL1	Q96KG9	808 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	THTPA	Q9BU02	230 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525		B2RBV5	119 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	CREB3	O43889	395 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP1A2	P05177	515 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	PGM1	P36871	562 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	GRM1	Q13255	1194 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	RAPH1	Q70E73	1250 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	CEP120	Q8N960	986 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	OTUD5	Q96G74	571 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	MED10	Q9BTT4	135 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	POLI	Q9UNA4	740 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	ENTPD5	O75356	428 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	BGN	P21810	368 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	NUMB	P49757	651 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	PEX5	P50542	639 aa		12.34	□□□□□ -0.43

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms