RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 MFSD6LQ8IWD5 586 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 CEP57L1Q8IYX8 460 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 PDCL2Q8N4E4 241 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 CXorf38Q8TB03 319 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 GCNAQ96QF7 691 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 ACBD6Q9BR61 282 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 MTMR12Q9C0I1 747 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 INTS13Q9NVM9 706 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 TSC2P49815 1807 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 F5P12259 2224 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 MAN2B1O00754 1011 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 SOAT2O75908 522 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 GABRR2P28476 465 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 CDC25CP30307 473 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 GDI1P31150 447 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 HOXD13P35453 343 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 VIPR2P41587 438 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 EHHADHQ08426 723 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 PKP1Q13835 747 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 VITQ6UXI7 678 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 GAREM2Q75VX8 874 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 DPH6Q7L8W6 267 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 FRMD5Q7Z6J6 570 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 LRRTM3Q86VH5 581 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 CBWD2Q8IUF1 395 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 TOP6BLQ8N6T0 577 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 ATXN3LQ9H3M9 355 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 SEMA4AQ9H3S1 761 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 HEBP1Q9NRV9 189 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 SIX4Q9UIU6 781 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 ZMYM5Q9UJ78 669 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 L1RE1Q9UN81 338 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 SNX9Q9Y5X1 595 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 HEPACAM2A8MVW5 462 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF263O14978 683 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 TGFB1I1O43294 461 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 GLULP15104 373 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 ATF6P18850 670 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 PCSK1P29120 753 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 WEE1P30291 646 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 LHX1P48742 406 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 BMT2Q1RMZ1 405 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 WDR49Q8IV35 697 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 YAF2Q8IY57 180 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 SCFD1Q8WVM8 642 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 LPIN3Q9BQK8 851 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 BLZF1Q9H2G9 400 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 ABCB6Q9NP58 842 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 OBP2AQ9NY56 170 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM186AA6NE01 2351 aa16.71■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 TCHHQ07283 1943 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 PRR23AA6NEV1 266 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 DPYSL4O14531 572 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 LRRN2O75325 713 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 SLFN14P0C7P3 912 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 AFMP43652 599 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 RPS9P46781 194 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 GPR158Q5T848 1215 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 C1orf228Q6PIY5 440 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 ASCL5Q7RTU5 278 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 ADGRF2Q8IZF7 708 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 XXYLT1Q8NBI6 393 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 GOLGA5Q8TBA6 731 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 CLDN23Q96B33 292 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 MSANTD3Q96H12 275 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 HPDLQ96IR7 371 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 FNBP1Q96RU3 617 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 TASP1Q9H6P5 420 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 USP25Q9UHP3 1055 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 USP34Q70CQ2 3546 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 GABRDO14764 452 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 CHADO15335 359 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 LAMTOR5O43504 91 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 CD72P21854 359 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 TARSP26639 723 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 KRT85P78386 507 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 FCHO2Q0JRZ9 810 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 CUL4BQ13620 913 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 PSMD6Q15008 389 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms