RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638708.1

STRADA-231, Transcript of STE20-related kinase adaptor alpha, human

TSL 2 BASIC

Gene STRADA, Length 2,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STRADA-231	ENST00000638708	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		11.66	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		11.66	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		11.66	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		11.66	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	ALOX15B	O15296	676 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	SGPL1	O95470	568 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	TFAP2A	P05549	437 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	CYP3A7	P24462	503 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	FMO1	Q01740	532 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	MEIS1	O00470	390 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	KLF11	O14901	512 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	P4HA2	O15460	535 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	SUPT3H	O75486	399 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	CLPTM1	O96005	669 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	PEX2	P28328	305 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	CDK8	P49336	464 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	CYP2J2	P51589	502 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	CDK18	Q07002	472 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	MORF4L2	Q15014	288 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	NADK2	Q4G0N4	442 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	ANO3	Q9BYT9	981 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	RMI1	Q9H9A7	625 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		11.65	□□□□□ -0.54
STRADA-231	ENST00000638708	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ATP2A1	O14983	1001 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	E2F6	O75461	281 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	FAM13A	O94988	1023 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	RALA	P11233	206 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	MAPK4	P31152	587 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	CETN1	Q12798	172 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	RASA3	Q14644	834 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	COG2	Q14746	738 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	EPC2	Q52LR7	807 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	LPCAT4	Q643R3	524 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	WWP1	Q9H0M0	922 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	THEG	Q9P2T0	379 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	TXNDC9	O14530	226 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	RGL2	O15211	777 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	PHB	P35232	272 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	MLH1	P40692	756 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ETV4	P43268	484 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	PSMD7	P51665	324 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	HIC1	Q14526	733 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	LPIN1	Q14693	890 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	APOPT1	Q96IL0	206 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	EMSY	Q7Z589	1322 aa		11.63	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms