RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 NFICP08651 508 aa29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC12A3P55017 1021 aa29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 AMPD2Q01433 879 aa29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF43Q68DV7 783 aa29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 CD302Q8IX05 232 aa29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 MAB21L3Q8N8X9 362 aa29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
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CAPNS1-217ENST00000629983 VPS45Q9NRW7 570 aa29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 TBX20Q9UMR3 447 aa29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 TM4SF5O14894 197 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 AKAP3O75969 853 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 EGFP01133 1207 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 NMT1P30419 496 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 HYIQ5T013 277 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC16Q8NEE8 873 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM83CQ9BQN1 747 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 ZMYM5Q9UJ78 669 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL26Q9Y258 94 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 CYB561D2O14569 222 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM189A1O60320 539 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNK5O95279 499 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP11A1P05108 521 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 SHC2P98077 582 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 ELF2Q15723 593 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 MCTP1Q6DN14 999 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 MYCT1Q8N699 235 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-217ENST00000629983 SPPL2BQ8TCT7 592 aa29.58■■■□□ 2.33
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
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CAPNS1-217ENST00000629983 VWA3AA6NCI4 1184 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM13AO94988 1023 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 ARSAP15289 507 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 PLK5Q496M5 336 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G2CQ5R387 149 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 TCEAL6Q6IPX3 200 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 CAMKK1Q8N5S9 505 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD17Q8N5Z5 321 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 TCEAL3Q969E4 200 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 ZHX3Q9H4I2 956 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF9Q9HAQ2 790 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
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CAPNS1-217ENST00000629983 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 PIRO00625 290 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF6P49848 677 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 GPBP1Q86WP2 473 aa29.56■■■□□ 2.32
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CAPNS1-217ENST00000629983 EXOC4Q96A65 974 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 REEP2Q9BRK0 252 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 EDEM2Q9BV94 578 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 TDP1Q9NUW8 608 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 ODF2LQ9ULJ1 636 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0B4J269 797 aa29.55■■■□□ 2.32
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CAPNS1-217ENST00000629983 PIGRP01833 764 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 ADRB2P07550 413 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 DRD1P21728 446 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 NLRP12P59046 1061 aa29.55■■■□□ 2.32
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CAPNS1-217ENST00000629983 WSCD1Q658N2 575 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 TXNDC8Q6A555 127 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 CHFRQ96EP1 664 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 P2RY13Q9BPV8 354 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 DERAQ9Y315 318 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 ANO9A1A5B4 782 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 RHOBTB1O94844 696 aa29.54■■■□□ 2.32
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CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM119Q4V9L6 283 aa29.54■■■□□ 2.32
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CAPNS1-217ENST00000629983 STKLD1Q8NE28 680 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 SCP2P22307 547 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 GBP1P32455 592 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 ACOT2P49753 483 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
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