RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF280BQ86YH2 543 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 MCOLN2Q8IZK6 566 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM35BQ8NCS4 154 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35G2Q8TBE7 412 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CASD1Q96PB1 797 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 ALS2CR12Q96Q35 445 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX25Q9H3E2 840 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 GTF3C4Q9UKN8 822 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 A8MXQ7 604 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 O00370 1275 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 B4GALT3O60512 393 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 EN2P19622 333 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 MON1BQ7L1V2 547 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 ACOT1Q86TX2 421 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 OSTM1Q86WC4 334 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 RHOT2Q8IXI1 618 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 COLGALT2Q8IYK4 626 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 CRYBG2Q8N1P7 616 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 WDTC1Q8N5D0 677 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 CTAGE9A4FU28 777 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 GABRDO14764 452 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 HOXA2O43364 376 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 B3GAT3O94766 335 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP1A2P05177 515 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 LMO2P25791 158 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 NOP2P46087 812 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 IKBKEQ14164 716 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 STILQ15468 1287 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 TIGD5Q53EQ6 642 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 WSCD1Q658N2 575 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 DENND1BQ6P3S1 775 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 DSTYKQ6XUX3 929 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 NPAS4Q8IUM7 802 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 ABI1Q8IZP0 508 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM86AQ8N2M4 240 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF653Q96CK0 615 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM11Q96F44 468 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 VCPIP1Q96JH7 1222 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 HCRTO43612 131 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 MICAL2O94851 1124 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 MYBL1P10243 752 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 HADHBP55084 474 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 C12orf29Q8N999 325 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 TPCN2Q8NHX9 752 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 DPEP3Q9H4B8 488 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 OSGEPQ9NPF4 335 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP83Q9Y592 693 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 GRID2IPA4D2P6 1211 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 PALMO75781 387 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 RAG1P15918 1043 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 MMP8P22894 467 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 PTP4A2Q12974 167 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 LCLAT1Q6UWP7 414 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 RSPH1Q8WYR4 309 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAI2Q9GZS0 605 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 COG5Q9UP83 839 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 MYH10P35580 1976 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 LTBP2Q14767 1821 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 M0QZQ0 153 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 MTA2O94776 668 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 PDGFRBP09619 1106 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 GATMP50440 423 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 MFSD5Q6N075 450 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAM22Q9P0K1 906 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPAN16Q9UKR8 245 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 JRKLQ9Y4A0 524 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF4AO95239 1232 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 BRCC3P46736 316 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 LHX1P48742 406 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP17Q68EM7 881 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC57Q8N9N7 239 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA18Q8TC71 538 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 TNIP3Q96KP6 325 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 C11orf70Q9BRQ4 267 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJB4Q9UDY4 337 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 TSC2P49815 1807 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP11A1P05108 521 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGB1P05556 798 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 ODC1P11926 461 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-215ENST00000628018 CSF2RAP15509 400 aa26.39■■□□□ 1.82
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