RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623613.1

AC004408.2-201, humanhuman

BASIC

Gene AC004408.2, Length 2,777 nt, Biotype TEC.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004408.2-201ENST00000623613 SLC24A2Q9UI40 661 aa20.16■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 CNTN6Q9UQ52 1028 aa20.16■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.16■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.16■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 WDR91A4D1P6 747 aa20.16■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 K7ERI5 159 aa20.16■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 PIAS1O75925 651 aa20.16■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 T-ENOLP0DO92 83 aa20.16■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 MAP3K10Q02779 954 aa20.16■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 NCOA4Q13772 614 aa20.16■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 EMC2Q15006 297 aa20.16■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.16■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 LONP2Q86WA8 852 aa20.16■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 ATG4CQ96DT6 458 aa20.16■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.16■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 FGFR1P11362 822 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 GPX6P59796 221 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 ACTR2P61160 394 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 ZNF394Q53GI3 561 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 CGRRF1Q99675 332 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 SHOC2Q9UQ13 582 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 MAFGO15525 162 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 RGS20O76081 388 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 CALB1P05937 261 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 SSTR1P30872 391 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 PSMC4P43686 418 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 DYNLT1P63172 113 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 GAD2Q05329 585 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 MTMR2Q13614 643 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 LRRC38Q5VT99 294 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 FAM13CQ8NE31 585 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 DEPTORQ8TB45 409 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 INPP5DQ92835 1189 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 TAF11Q15544 211 aa20.14■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 HIF1AQ16665 826 aa20.14■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.14■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.14■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa20.14■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 NPHS2Q9NP85 383 aa20.14■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 FBXO40Q9UH90 709 aa20.14■□□□□ 0.82
AC004408.2-201ENST00000623613 NEBLO76041 1014 aa20.14■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 ITGAVP06756 1048 aa20.14■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 BRD2P25440 801 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 CDKN2BP42772 138 aa20.14■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 TFDP1Q14186 410 aa20.14■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 CCDC125Q86Z20 511 aa20.14■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 PYROXD1Q8WU10 500 aa20.14■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 VWA5AO00534 786 aa20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 EPHB2P29323 1055 aa20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 ABCD1P33897 745 aa20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 XKR3Q5GH77 459 aa20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 EFHC2Q5JST6 749 aa20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 RABGEF1Q9UJ41 708 aa20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 CLUHO75153 1309 aa20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 PEX11AO75192 247 aa20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 CALB2P22676 271 aa20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 CCNG1P51959 295 aa20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 MTM1Q13496 603 aa20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 MAPK6Q16659 721 aa20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 PPCSQ9HAB8 311 aa20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 ZFP69BQ9UJL9 534 aa20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.13■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 WNT10BO00744 389 aa20.12■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 GLRA2P23416 452 aa20.12■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 ADRA1DP25100 572 aa20.12■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 RASSF2P50749 326 aa20.12■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 FYB2Q5VWT5 728 aa20.12■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.12■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa20.12■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.12■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.12■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 WDR81Q562E7 1941 aa20.12■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa20.12■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 GOLGA8RI6L899 631 aa20.12■□□□□ 0.81
AC004408.2-201ENST00000623613 ZWINTO95229 277 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms