RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CES2	O00748	559 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CBX6	O95503	412 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	RAD23B	P54727	409 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	GLRA2	P23416	452 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	NPNT	Q6UXI9	565 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	B4GALT5	O43286	388 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	NXN	Q6DKJ4	435 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP4X1	Q8N118	509 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	KLK14	Q9P0G3	267 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	GYG2	O15488	501 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	MED7	O43513	233 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	ROR1	Q01973	937 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	MAMLD1	Q13495	774 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	MROH9	Q5TGP6	573 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	TMC2	Q8TDI7	906 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	SERPINB12	Q96P63	405 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	ECHS1	P30084	290 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	EPHB1	P54762	984 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CAV1	Q03135	178 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	MMRN1	Q13201	1228 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	NME3	Q13232	169 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	LGSN	Q5TDP6	509 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	LONP2	Q86WA8	852 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ACSS3-208	ENST00000616449	CIB2	O75838	187 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	UPP2	O95045	317 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	FSTL1	Q12841	308 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	WHRN	Q9P202	907 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A1W2PPM1	405 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	GART	P22102	1010 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	PTGIR	P43119	386 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	ARFIP2	P53365	341 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	PGM2	Q96G03	612 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	TTC1	Q99614	292 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	VPS11	Q9H270	941 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A1B0GUL6	1792 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	NPTXR	O95502	500 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP1A2	P05177	515 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	ADRA1D	P25100	572 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ACSS3-208	ENST00000616449	SDC4	P31431	198 aa		13.39	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms