RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613876.1

CCL23-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 23, humanhuman

TSL 3

Gene CCL23, Length 402 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23-202ENST00000613876 APPL2Q8NEU8 664 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 TRIM58Q8NG06 486 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 TPCN2Q8NHX9 752 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 SLC35G2Q8TBE7 412 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 URGCPQ8TCY9 931 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 VCPIP1Q96JH7 1222 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 UROC1Q96N76 676 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 NOX5Q96PH1 765 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 LPIN3Q9BQK8 851 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 TBC1D13Q9NVG8 400 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 ADAM22Q9P0K1 906 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 LRFN2Q9ULH4 789 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 TET1Q8NFU7 2136 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 MYH10P35580 1976 aa5.66□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 TANC1Q9C0D5 1861 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa5.65□□□□□ -1.5
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CCL23-202ENST00000613876 M0QZQ0 153 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 O00370 1275 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 GABRDO14764 452 aa5.65□□□□□ -1.5
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CCL23-202ENST00000613876 HCRTO43612 131 aa5.65□□□□□ -1.5
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CCL23-202ENST00000613876 PALMO75781 387 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 URI1O94763 535 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 B3GAT3O94766 335 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 MTA2O94776 668 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 LSM8O95777 96 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 ALDH2P05091 517 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 ITGB1P05556 798 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 PFKMP08237 780 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 MYBL1P10243 752 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 RAG1P15918 1043 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 MMP8P22894 467 aa5.65□□□□□ -1.5
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CCL23-202ENST00000613876 LHX1P48742 406 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 GATMP50440 423 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 HADHBP55084 474 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 STILQ15468 1287 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 C2CD6Q53TS8 623 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 LIN9Q5TKA1 542 aa5.65□□□□□ -1.5
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CCL23-202ENST00000613876 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa5.65□□□□□ -1.5
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CCL23-202ENST00000613876 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
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CCL23-202ENST00000613876 SLFN11Q7Z7L1 901 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 ERICH1Q86X53 443 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 RHOT2Q8IXI1 618 aa5.65□□□□□ -1.5
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CCL23-202ENST00000613876 UBA3Q8TBC4 463 aa5.65□□□□□ -1.5
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CCL23-202ENST00000613876 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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CCL23-202ENST00000613876 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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CCL23-202ENST00000613876 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 CYTH4Q9UIA0 394 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 GTF3C4Q9UKN8 822 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 COG5Q9UP83 839 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 JRKLQ9Y4A0 524 aa5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CCL23-202ENST00000613876 TTC3P53804 2025 aa5.64□□□□□ -1.51
CCL23-202ENST00000613876 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa5.64□□□□□ -1.51
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