RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ARHGEF3Q9NR81 526 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 CEP72Q9P209 647 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 RCOR1Q9UKL0 485 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ITGA11Q9UKX5 1188 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ZDHHC9Q9Y397 364 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 SNX9Q9Y5X1 595 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 UBE4BO95155 1302 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1W2PRU2 124 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 KRBA1A5PL33 1030 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ANHXE9PGG2 379 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 VNN2O95498 520 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 SLFN14P0C7P3 912 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 TNNI1P19237 187 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 PAX3P23760 479 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 HOXD13P35453 343 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 CCR2P41597 374 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 SYKP43405 635 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 GPC5P78333 572 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 GPR17Q13304 367 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 GRM2Q14416 872 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 VEPH1Q14D04 833 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 TEAD2Q15562 447 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 FSIP1Q8NA03 581 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 OR5B17Q8NGF7 314 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 GIPC2Q8TF65 315 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 SCFD1Q8WVM8 642 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 PAGE5Q96GU1 130 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 LPIN3Q9BQK8 851 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNH6Q9H252 994 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 TBC1D17Q9HA65 648 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 PTPRJQ12913 1337 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 MUC6Q6W4X9 2439 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 COL4A3Q01955 1670 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 H0Y858 1186 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 PI15O43692 258 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 CYP11A1P05108 521 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 NDUFA8P51970 172 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 RBP5P82980 135 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 MYO1EQ12965 1108 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 SURF1Q15526 300 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 PRSS36Q5K4E3 855 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 SCARA3Q6AZY7 606 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 CENPPQ6IPU0 288 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 CNNM4Q6P4Q7 775 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 GPIHBP1Q8IV16 184 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ADGRF2Q8IZF7 708 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 PDCL2Q8N4E4 241 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 STKLD1Q8NE28 680 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF507Q8TCN5 953 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 GCNAQ96QF7 691 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 MMS19Q96T76 1030 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 PRRX2Q99811 253 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 KIAA1586Q9HCI6 787 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 INTS13Q9NVM9 706 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 GDE1Q9NZC3 331 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 WNT16Q9UBV4 365 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 MAFFQ9ULX9 164 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 L1RE1Q9UN81 338 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 WDFY4Q6ZS81 3184 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 TGFB1I1O43294 461 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 HCRTO43612 131 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 EXOC3O60645 756 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 PHACTR2O75167 634 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 NPR3P17342 541 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 AOC1P19801 751 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 CMA1P23946 247 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 GABRR2P28476 465 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 CLCN5P51795 746 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 MYL7Q01449 175 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 CYP24A1Q07973 514 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 TCF15Q12870 199 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 UBXN2BQ14CS0 331 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 DUOXA2Q1HG44 320 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM78AQ5JUQ0 283 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 STXBP5Q5T5C0 1151 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 TANGO2Q6ICL3 276 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ITIH5Q86UX2 942 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 PACS2Q86VP3 889 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms