RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, human

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD2-208	ENST00000587269	MYO1E	Q12965	1108 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	BORCS6	Q96GS4	357 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	LRRC3	Q9BY71	257 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	31.75	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	GPR158	Q5T848	1215 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	GIPC2	Q8TF65	315 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	GLUL	P15104	373 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	CDC25C	P30307	473 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	WNT7B	P56706	349 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	USP34	Q70CQ2	3546 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	SP9	P0CG40	484 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	UNC13D	Q70J99	1090 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	GAREM2	Q75VX8	874 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	ACBD6	Q9BR61	282 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	INTS13	Q9NVM9	706 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	L1RE1	Q9UN81	338 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269		R4GN57	208 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	AFM	P43652	599 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	LHX1	P48742	406 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	RDH13	Q8NBN7	331 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	FNBP1	Q96RU3	617 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	TSC2	P49815	1807 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	PCSK1	P29120	753 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	FAM3C	Q92520	227 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	TASP1	Q9H6P5	420 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SMAD2-208	ENST00000587269	UBE4B	O95155	1302 aa		31.7	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	CHAD	O15335	359 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	ATF6	P18850	670 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	RESP18	Q5W5W9	173 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	ADSSL1	Q8N142	457 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	SPATA18	Q8TC71	538 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	HPDL	Q96IR7	371 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	TNNI1	P19237	187 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	CYP2J2	P51589	502 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	CLDN23	Q96B33	292 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	CLIC2	O15247	247 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	CSH1	P0DML2	217 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	CSH2	P0DML3	217 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	CYP4F8	P98187	520 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
SMAD2-208	ENST00000587269	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		31.67	■■■□□ 2.66

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