RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568227.5

SNAP23-215, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-215	ENST00000568227	JTB	O76095	146 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	NR2F6	P10588	404 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	DRD4	P21917	467 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	CCND1	P24385	295 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	CERS1	P27544	350 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	CD6	P30203	668 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	ALDH9A1	P49189	494 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	HK3	P52790	923 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	TBC1D5	Q92609	795 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	RNF7	Q9UBF6	113 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	RAD54B	Q9Y620	910 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-215	ENST00000568227	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	PROB1	E7EW31	1015 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	TLR5	O60602	858 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	RHO	P08100	348 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM163B	P0C2L3	166 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	NDUFB7	P17568	137 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	NOG	Q13253	232 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	TBCC	Q15814	346 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	PTPN21	Q16825	1174 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF425	Q6IV72	752 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	USP37	Q86T82	979 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	DTX2	Q86UW9	622 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	KATNA1	O75449	491 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	LATS1	O95835	1130 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	EBLN1	P0CF75	366 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	PDC	P20941	246 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	TFF2	Q03403	129 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM240	Q5SV17	173 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	ICE2	Q659A1	982 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	PRR18	Q8N4B5	295 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	CPA6	Q8N4T0	437 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	RGMA	Q96B86	450 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF778	Q96MU6	729 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	TNKS	O95271	1327 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	WDR91	A4D1P6	747 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	KIF20A	O95235	890 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	TYR	P14679	529 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	VCAM1	P19320	739 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	PCSK6	P29122	969 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	PTGER1	P34995	402 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	AMPD3	Q01432	767 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	MAPK7	Q13164	816 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	ODF1	Q14990	250 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	MTX3	Q5HYI7	312 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	EMC10	Q5UCC4	262 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	USP45	Q70EL2	814 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	DDB2	Q92466	427 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-215	ENST00000568227	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9

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