RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	SMARCD2	Q92925	531 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	PHOX2B	Q99453	314 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ACBD6	Q9BR61	282 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	COL4A3	Q01955	1670 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	GABRD	O14764	452 aa		23.41	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	CDR1	P51861	262 aa		23.41	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP24A1	Q07973	514 aa		23.41	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMD6	Q15008	389 aa		23.41	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	TEAD2	Q15562	447 aa		23.41	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		23.41	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		23.41	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		23.41	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	23.41	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	RDH13	Q8NBN7	331 aa		23.41	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		23.41	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	PKMYT1	Q99640	499 aa		23.41	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	23.41	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		23.41	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PQ27	194 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PQ64	194 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PQD8	194 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PRU2	124 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	TNNC2	P02585	160 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	SYK	P43405	635 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	PFKP	Q01813	784 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMD2	Q13200	908 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	GAREM2	Q75VX8	874 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ITIH5	Q86UX2	942 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	OSTM1	Q86WC4	334 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	HPDL	Q96IR7	371 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR88	Q9GZN0	384 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	23.4	■■□□□ 1.34
PPP4C-205	ENST00000563200		H0Y858	1186 aa		23.39	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	23.39	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPY1	Q01534	308 aa		23.39	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO1E	Q12965	1108 aa		23.39	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		23.39	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		23.39	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	DPH6	Q7L8W6	267 aa		23.39	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	23.39	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	CGRRF1	Q99675	332 aa		23.39	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		23.39	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	EXOC1	Q9NV70	894 aa		23.39	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	23.39	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		23.39	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	NCAN	O14594	1321 aa		23.38	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	23.38	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	23.38	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	23.38	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	23.38	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		23.38	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		23.38	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		23.38	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	SHD	Q96IW2	340 aa		23.38	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		23.38	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		23.38	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	IL21	Q9HBE4	155 aa		23.38	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	DMAC2	Q9NW81	257 aa		23.38	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		23.38	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	COL4A2	P08572	1712 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	STK25	O00506	426 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HCRT	O43612	131 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	TNNI1	P19237	187 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	VIPR2	P41587	438 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	LHX1	P48742	406 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	MRE11	P49959	708 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	MYL7	Q01449	175 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKCQ	Q04759	706 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	VIT	Q6UXI7	678 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF516	Q92618	1163 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	FNBP1	Q96RU3	617 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXQ1	Q9C009	403 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	FGF19	O95750	216 aa		23.36	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR29	P0C7W0	189 aa		23.36	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	GABRR2	P28476	465 aa		23.36	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	GRM2	Q14416	872 aa		23.36	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		23.36	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	FSIP1	Q8NA03	581 aa		23.36	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PJA1	Q8NG27	643 aa		23.36	■■□□□ 1.33

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