RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF503Q96F45 646 aa6.22□□□□□ -1.41
USP3-AS1-202ENST00000559357 USP28Q96RU2 1077 aa6.22□□□□□ -1.41
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPZ1Q9BXG8 430 aa6.22□□□□□ -1.41
USP3-AS1-202ENST00000559357 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
USP3-AS1-202ENST00000559357 CLIC4Q9Y696 253 aa6.22□□□□□ -1.41
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.22□□□□□ -1.41
USP3-AS1-202ENST00000559357 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
USP3-AS1-202ENST00000559357 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 GLTPD2A6NH11 291 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM232C9JQI7 657 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 MATN2O00339 956 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAN2B1O00754 1011 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADAMTS3O15072 1205 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 ASNSP08243 561 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 SNHG28P0DPA3 235 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 CR2P20023 1033 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM83BQ5T0W9 1011 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC148Q8NFR7 591 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 BICD2Q8TD16 824 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 MKL1Q969V6 931 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 COA7Q96BR5 231 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 HOOK2Q96ED9 719 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 SH2D4AQ9H788 454 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 CFAP45Q9UL16 551 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.21□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 PARP14Q460N5 1801 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 AQP7O14520 342 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADCY3O60266 1144 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 MBD3O95983 291 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 CALML3P27482 149 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 ME1P48163 572 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 RRADP55042 308 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 UBE2HP62256 183 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 IL13RA1P78552 427 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 NFYCQ13952 458 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 USH1GQ495M9 461 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 NRN1LQ496H8 165 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 FIGNQ5HY92 759 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANO1Q5XXA6 986 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC174Q6PII3 467 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPATC1Q76KD6 591 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 HOMEZQ8IX15 550 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 BLIDQ8IZY5 108 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDCA5Q96FF9 252 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 SCYL1Q96KG9 808 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 VCPKMTQ9H867 229 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 BARHL2Q9NY43 387 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMX2Q9Y320 296 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTPRFP10586 1907 aa6.19□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 UTRNP46939 3433 aa6.19□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.19□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 SMCO2A6NFE2 343 aa6.19□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRIM75PA6NK02 468 aa6.19□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARVCFO00192 962 aa6.19□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZBTB5O15062 677 aa6.19□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPTLC2O15270 562 aa6.19□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTGS1P23219 599 aa6.19□□□□□ -1.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 SMARCA1P28370 1054 aa6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms