RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 CBWD6Q4V339 395 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-208ENST00000558954 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-208ENST00000558954 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-208ENST00000558954 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-208ENST00000558954 GPR149Q86SP6 731 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.21■□□□□ 0.83
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RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM209Q96SK2 561 aa20.21■□□□□ 0.83
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RABGGTA-208ENST00000558954 POLIQ9UNA4 740 aa20.21■□□□□ 0.83
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RABGGTA-208ENST00000558954 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
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RABGGTA-208ENST00000558954 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 THAP9Q9H5L6 903 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
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RABGGTA-208ENST00000558954 SPOPLQ6IQ16 392 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 SYT15Q9BQS2 421 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 PIDD1Q9HB75 910 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 RAB20Q9NX57 234 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 CDH9Q9ULB4 789 aa20.19■□□□□ 0.82
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RABGGTA-208ENST00000558954 PMM2O15305 246 aa20.18■□□□□ 0.82
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RABGGTA-208ENST00000558954 WEE2P0C1S8 567 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 ASPAP45381 313 aa20.18■□□□□ 0.82
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RABGGTA-208ENST00000558954 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 CDH22Q9UJ99 828 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 YIPF1Q9Y548 306 aa20.18■□□□□ 0.82
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RABGGTA-208ENST00000558954 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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RABGGTA-208ENST00000558954 KCNH2Q12809 1159 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 DUSP4Q13115 394 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 PLD1Q13393 1074 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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RABGGTA-208ENST00000558954 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 POMKQ9H5K3 350 aa20.17■□□□□ 0.82
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RABGGTA-208ENST00000558954 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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RABGGTA-208ENST00000558954 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 MYO10Q9HD67 2058 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 HCRTO43612 131 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 LMO2P25791 158 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 ELMOD1Q8N336 334 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 FEZF2Q8TBJ5 459 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 PKMYT1Q99640 499 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-208ENST00000558954 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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