RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	DRC1	Q96MC2	740 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	TNMD	Q9H2S6	317 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	USP25	Q9UHP3	1055 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	LAMA5	O15230	3695 aa		15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	MYMK	A6NI61	221 aa		15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	PRAMEF12	O95522	483 aa		15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	EGF	P01133	1207 aa		15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	OSTN	P61366	133 aa		15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	TMC8	Q8IU68	726 aa		15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	DDX12P	Q92771	950 aa		15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	GBP4	Q96PP9	640 aa		15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	REEP2	Q9BRK0	252 aa		15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	FZD8	Q9H461	694 aa		15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	ITPR1	Q14643	2758 aa		15	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	MYH11	P35749	1972 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	MICAL2	O94851	1124 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	ZNF202	O95125	648 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	NAMPT	P43490	491 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	UBE2H	P62256	183 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	FAM193A	P78312	1265 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	IRX4	P78413	519 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	14.99	□□□□□ -0.01	6e-13	■□□□□ 9.5
CS-231	ENST00000552222	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	IQCE	Q6IPM2	695 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	ASAH2	Q9NR71	780 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	ADAMTS20	P59510	1910 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	SFI1	A8K8P3	1242 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	RNF40	O75150	1001 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	PLS3	P13797	630 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	BCKDHB	P21953	392 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	ZNF131	P52739	623 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	EPHA5	P54756	1037 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	AMPD3	Q01432	767 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	PPP2R5A	Q15172	486 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	GAREM2	Q75VX8	874 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	PDZD3	Q86UT5	571 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	IFT74	Q96LB3	600 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	TRIM9	Q9C026	710 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	YIPF1	Q9Y548	306 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		14.97	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	PODXL	O00592	558 aa		14.97	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	CAPNS1	P04632	268 aa		14.97	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	GBP1	P32455	592 aa		14.97	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	NPTX2	P47972	431 aa		14.97	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	PEX3	P56589	373 aa		14.97	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	CYP4F8	P98187	520 aa		14.97	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		14.97	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		14.97	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		14.97	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	RTL10	Q7L3V2	364 aa		14.97	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	DYM	Q7RTS9	669 aa		14.97	□□□□□ -0.01
CS-231	ENST00000552222	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		14.97	□□□□□ -0.01

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