RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 ACOT1Q86TX2 421 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 DNAAF5Q86Y56 855 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 C12orf29Q8N999 325 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 OR10T2Q8NGX3 314 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 FAM81BQ96LP2 452 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PCDHB18PQ96TA0 734 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 C17orf80Q9BSJ5 609 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.69□□□□□ -1.02
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CS-216ENST00000549221 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.69□□□□□ -1.02
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CS-216ENST00000549221 CHD9Q3L8U1 2897 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 A8MXQ7 604 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.021e-14■■□□□ 14.3
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CS-216ENST00000549221 SERPING1P05155 500 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 MMEP08473 750 aa8.68□□□□□ -1.02
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CS-216ENST00000549221 TYMPP19971 482 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 CDK17Q00537 523 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 FMO1Q01740 532 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 KLHL30Q0D2K2 578 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 DPH6Q7L8W6 267 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TMEM176AQ96HP8 235 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PKMYT1Q99640 499 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PBX4Q9BYU1 374 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 SNX25Q9H3E2 840 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 FAM49BQ9NUQ9 324 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TMLHEQ9NVH6 421 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 SPG21Q9NZD8 308 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PYCARDQ9ULZ3 195 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 NENFQ9UMX5 172 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.025e-8■□□□□ 9.8
CS-216ENST00000549221 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 114.2
CS-216ENST00000549221 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 A0A087X0T9 212 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 A0A0U1RQJ8 604 aa8.67□□□□□ -1.02
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CS-216ENST00000549221 FAM163BP0C2L3 166 aa8.67□□□□□ -1.02
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CS-216ENST00000549221 DNAJB1P25685 340 aa8.67□□□□□ -1.02
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CS-216ENST00000549221 CTNNB1P35222 781 aa8.67□□□□□ -1.02
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CS-216ENST00000549221 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PAQR9Q6ZVX9 377 aa8.67□□□□□ -1.02
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CS-216ENST00000549221 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.67□□□□□ -1.02
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CS-216ENST00000549221 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
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