RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF22	Q14807	665 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PRR16	Q569H4	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SNX22	Q96L94	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	GDF15	Q99988	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGAP6	O43182	974 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC26A4	O43511	780 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF202	O95125	648 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MT-ND5	P03915	603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CR2	P20023	1033 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNJ5	P48544	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	NOMO3	P69849	1222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PTH1R	Q03431	593 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	HGFAC	Q04756	655 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CTBP1	Q13363	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	NPC1	O15118	1278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	TEX33	O43247	280 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC43A1	O75387	559 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAJB5	O75953	348 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	AGR2	O95994	175 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	GJB1	P08034	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	RAP2A	P10114	183 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	HSD3B1	P14060	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	APBA1	Q02410	837 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	DUSP8	Q13202	625 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ZACN	Q401N2	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	LPP	Q93052	612 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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