RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 TMEM174Q8WUU8 243 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 PSMG2Q969U7 264 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 HPDLQ96IR7 371 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 KXD1Q9BQD3 176 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 ACBD6Q9BR61 282 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 KCTD10Q9H3F6 313 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 KRBA1A5PL33 1030 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 RHOBTB3O94955 611 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 KIF20AO95235 890 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 LHX1P48742 406 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 GPC5P78333 572 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 MGAT5BQ3V5L5 792 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 ITIH5Q86UX2 942 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 ADGRF2Q8IZF7 708 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 TMEM105Q8N8V8 129 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 SHKBP1Q8TBC3 707 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 ELSPBP1Q96BH3 223 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC127Q96BQ5 260 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC34Q96HJ3 373 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 GPR88Q9GZN0 384 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 DMAC2Q9NW81 257 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 CA14Q9ULX7 337 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 PDXKO00764 312 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 GABRDO14764 452 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 SOAT2O75908 522 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 FGF19O95750 216 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 AOC1P19801 751 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 PTPN5P54829 565 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 VEPH1Q14D04 833 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 SOWAHAQ2M3V2 549 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 LIMS2Q7Z4I7 341 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 OSTM1Q86WC4 334 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 ASB16Q96NS5 453 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 ZFP14Q9HCL3 533 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 ARHGEF3Q9NR81 526 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 TMLHEQ9NVH6 421 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 CALUO43852 315 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 GJA1P17302 382 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 ATF6P18850 670 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 FCARP24071 287 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 PCSK1P29120 753 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 PFKPQ01813 784 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 NHLH1Q02575 133 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 KCNB1Q14721 858 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 TEAD2Q15562 447 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 FAM78AQ5JUQ0 283 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 TANGO2Q6ICL3 276 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 FAM200AQ8TCP9 573 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 PKMYT1Q99640 499 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 LPIN3Q9BQK8 851 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 TRIOO75962 3097 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 A0A1W2PRU2 124 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 STAU1O95793 577 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 CST3P01034 146 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 NR3C1P04150 777 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 RFX1P22670 979 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 AP3M2P53677 418 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 TCF15Q12870 199 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 PLEKHO2Q8TD55 490 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 PARD3BQ8TEW8 1205 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF516Q92618 1163 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 SMARCD2Q92925 531 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 ZSWIM3Q96MP5 696 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 TBC1D17Q9HA65 648 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 TRPV4Q9HBA0 871 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 ABCB6Q9NP58 842 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD8-204ENST00000544999 STK25O00506 426 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD8-204ENST00000544999 FAM163BP0C2L3 166 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD8-204ENST00000544999 WARSP23381 471 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
HOXD8-204ENST00000544999 ATICP31939 592 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD8-204ENST00000544999 CDR1P51861 262 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD8-204ENST00000544999 TRPC3Q13507 836 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD8-204ENST00000544999 NFIL3Q16649 462 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD8-204ENST00000544999 GAREM2Q75VX8 874 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD8-204ENST00000544999 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
HOXD8-204ENST00000544999 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
HOXD8-204ENST00000544999 SHDQ96IW2 340 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD8-204ENST00000544999 PI4K2AQ9BTU6 479 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD8-204ENST00000544999 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD8-204ENST00000544999 ATXN3LQ9H3M9 355 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD8-204ENST00000544999 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms