RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543185.5

HDAC4-215, Transcript of histone deacetylase 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HDAC4, Length 8,990 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4-215ENST00000543185 SPATA17Q96L03 361 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 DENND3A2RUS2 1198 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 GRK2P25098 689 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 DDR2Q16832 855 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 SETD9Q8NE22 299 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 PPP1R36Q96LQ0 422 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 ZNF23P17027 643 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 OR8H2Q8N162 312 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 HES6Q96HZ4 224 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 WASHC2DQ5SRD0 308 aa20.14■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.14■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 LY9Q9HBG7 655 aa20.14■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 TAGLN3Q9UI15 199 aa20.14■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 YY1P25490 414 aa20.14■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 LXNQ9BS40 222 aa20.14■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.14■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 HSD17B3P37058 310 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 DYRK4Q9NR20 520 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 CCZ1BP86790 482 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 KRT78Q8N1N4 520 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 CHI3L2Q15782 390 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 GLI2P10070 1586 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 KATNA1O75449 491 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 LATS2Q9NRM7 1088 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 CDK8P49336 464 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 ELMO2Q96JJ3 720 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 CLCA2Q9UQC9 943 aa20.14■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 LRRC74AQ0VAA2 488 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 SLC20A2Q08357 652 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 GRM4Q14833 912 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 ZNF333Q96JL9 665 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 SOAT2O75908 522 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 DGUOKQ16854 277 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 PMF1Q6P1K2 205 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 STK39Q9UEW8 545 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 PCSK1NQ9UHG2 260 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 PKP3Q9Y446 797 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 ZNF521Q96K83 1311 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 TXNRD1Q16881 649 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 ASZ1Q8WWH4 475 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 FDX1P10109 184 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 PTPN4P29074 926 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 PSMC5P62195 406 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 CNTN1Q12860 1018 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 FMO5P49326 533 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 POU4F1Q01851 419 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 NME3Q13232 169 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 COA7Q96BR5 231 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 RMDN3Q96TC7 470 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 CD274Q9NZQ7 290 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 PRLRP16471 622 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 ACADSBP45954 432 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 USP10Q14694 798 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 ALX1Q15699 326 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 TMCC3Q9ULS5 477 aa20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 SDE2Q6IQ49 451 aa20.12■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.12■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.12■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 MAPK7Q13164 816 aa20.12■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa20.12■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 UTYO14607 1347 aa20.12■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 PRIM2P49643 509 aa20.12■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 SPATA2Q9UM82 520 aa20.12■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.12■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 ZIM3Q96PE6 472 aa20.12■□□□□ 0.81
HDAC4-215ENST00000543185 ZNF302Q9NR11 478 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms