RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
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PTPRB-204ENST00000538708 REPS2Q8NFH8 660 aa9.9□□□□□ -0.82
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PTPRB-204ENST00000538708 PGLYRP2Q96PD5 576 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PGK1P00558 417 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-204ENST00000538708 TGFB3P10600 412 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-204ENST00000538708 EPHB2P29323 1055 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF284Q2VY69 593 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-204ENST00000538708 RD3Q7Z3Z2 195 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-204ENST00000538708 NT5DC4Q86YG4 428 aa9.9□□□□□ -0.83
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