RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534401.5

PKP3-211, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 756 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-211ENST00000534401 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.9■■□□□ 1.26
PKP3-211ENST00000534401 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PKP3-211ENST00000534401 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.9■■□□□ 1.26
PKP3-211ENST00000534401 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.9■■□□□ 1.26
PKP3-211ENST00000534401 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PKP3-211ENST00000534401 ANHXE9PGG2 379 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 CETN3O15182 167 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 MYL7Q01449 175 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 TWF1Q12792 350 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 PLD1Q13393 1074 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 NCOA4Q13772 614 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 POTEHQ6S545 545 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 ITFG1Q8TB96 612 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 NXPE3Q969Y0 559 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 ABCB6Q9NP58 842 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 CDH7Q9ULB5 785 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 ASB3Q9Y575 518 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 PTPRDP23468 1912 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 PCSK1P29120 753 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 GTF2H1P32780 548 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 TUFMP49411 452 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 TSPY1Q01534 308 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 PPP3CAQ08209 521 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 TRPC3Q13507 836 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 LEMD2Q8NC56 503 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 TAF4BQ92750 862 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 FGF13Q92913 245 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 POLIQ9UNA4 740 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 NME7Q9Y5B8 376 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 PSMA7O14818 248 aa22.87■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 PHACTR2O75167 634 aa22.87■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 MOSPD3O75425 235 aa22.87■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 LMO2P25791 158 aa22.87■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.87■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 ISM2Q6H9L7 571 aa22.87■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 TTI2Q6NXR4 508 aa22.87■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.87■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 TSG101Q99816 390 aa22.87■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 KCNK12Q9HB15 430 aa22.87■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 CDH9Q9ULB4 789 aa22.87■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.87■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 HCRTO43612 131 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 ASGR2P07307 311 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 KRT13P13646 458 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 CCR2P41597 374 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 ALDH1A3P47895 512 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 BIRC3Q13489 604 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 STIM1Q13586 685 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 HTR4Q13639 388 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 TMC8Q8IU68 726 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 ELMOD1Q8N336 334 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 PSMG2Q969U7 264 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 GDE1Q9NZC3 331 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 ZNF197O14709 1029 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 HLA-DRAP01903 254 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 TRIM49P0CI25 452 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 TRIM49CP0CI26 452 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 ATF6P18850 670 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 EPHB3P54753 998 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 IQCEQ6IPM2 695 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 CEP63Q96MT8 703 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 MMS19Q96T76 1030 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 CORO1BQ9BR76 489 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PKP3-211ENST00000534401 COL9A1P20849 921 aa22.84■■□□□ 1.25
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