RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-222	ENST00000533557	XBP1	P17861	261 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-222	ENST00000533557	TNFSF9	P41273	254 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-222	ENST00000533557	DGKE	P52429	567 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-222	ENST00000533557	TXNDC8	Q6A555	127 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-222	ENST00000533557	PIP4P1	Q86T03	277 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-222	ENST00000533557	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-222	ENST00000533557	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-222	ENST00000533557	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-222	ENST00000533557	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-222	ENST00000533557	KIFAP3	Q92845	792 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-222	ENST00000533557	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-222	ENST00000533557	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-222	ENST00000533557	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-222	ENST00000533557	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ADAMTS20	P59510	1910 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	TTC26	A0AVF1	554 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	SLC16A4	O15374	487 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	HIP1R	O75146	1068 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	DRD1	P21728	446 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	MYBPC2	Q14324	1141 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF174	Q15697	407 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	RASSF3	Q86WH2	238 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	PROSER1	Q86XN7	944 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	RLN3	Q8WXF3	142 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	PIGK	Q92643	395 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	THADA	Q6YHU6	1953 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	CIT	O14578	2027 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	LACTBL1	A8MY62	500 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557		E9PMD0	336 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	CDKL5	O76039	1030 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	TYMP	P19971	482 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	PTGER3	P43115	390 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	MAPK8	P45983	427 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	GPR15	P49685	360 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	NLRP12	P59046	1061 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	LILRA4	P59901	499 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	MESP2	Q0VG99	397 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	SEMA3B	Q13214	749 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	KCNK18	Q7Z418	384 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	USP37	Q86T82	979 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	SENP8	Q96LD8	212 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	SLC22A12	Q96S37	553 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	TDP1	Q9NUW8	608 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	APC2	O95996	2303 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557		K7EQS6	105 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	JAK2	O60674	1132 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	TADA3	O75528	432 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	FGF19	O95750	216 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	CDC25C	P30307	473 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	PTPA	Q15257	358 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	GAB4	Q2WGN9	574 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ANO7	Q6IWH7	933 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	PDZD3	Q86UT5	571 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ITIH5	Q86UX2	942 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	USP33	Q8TEY7	942 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	KIF12	Q96FN5	646 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	FAM189A1	O60320	539 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	TOM1L1	O75674	476 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ENG	P17813	658 aa		13.17	□□□□□ -0.3

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