RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533252.1

CASP4-211, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 3

Gene CASP4, Length 215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-211ENST00000533252 GADL1Q6ZQY3 521 aa5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 TMEM151BQ8IW70 566 aa5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 PJA1Q8NG27 643 aa5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 FEZF2Q8TBJ5 459 aa5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 IFI44Q8TCB0 444 aa5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 GNRHR2Q96P88 292 aa5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 EPC1Q9H2F5 836 aa5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 LANCL2Q9NS86 450 aa5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 CPA4Q9UI42 421 aa5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 DUSP10Q9Y6W6 482 aa5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 ADAMTS20P59510 1910 aa5.87□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 PMM2O15305 246 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 TRIM13O60858 407 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 SBK3P0C264 359 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 GYPEP15421 78 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 MALP21145 153 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 ALDH1A3P47895 512 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 HK3P52790 923 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 WNT3AP56704 352 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 RPS8P62241 208 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 ATP8B2P98198 1209 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 GRAPQ13588 217 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 RIN1Q13671 783 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 AFMIDQ63HM1 303 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 DAAM2Q86T65 1068 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 SKAP1Q86WV1 359 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 XYLT1Q86Y38 959 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 GPR135Q8IZ08 494 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 CCDC191Q8NCU4 936 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 C3orf20Q8ND61 904 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 SLC35B2Q8TB61 432 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 MYH16Q9H6N6 1097 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 FAM204AQ9H8W3 233 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 JADE2Q9NQC1 790 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 KMT5AQ9NQR1 393 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 LMBRD1Q9NUN5 540 aa5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 ATRNL1Q5VV63 1379 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 CFAP69A5D8W1 941 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 PLIN1O60240 522 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 CDC14BO60729 498 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 GPR32O75388 356 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 NTSR2O95665 410 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 BMP7P18075 431 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 GUCY1A2P33402 732 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 CRHR1P34998 444 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 PHKA1P46020 1223 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 KCNJ4P48050 445 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 NPEPPSP55786 919 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 TLE1Q04724 770 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 KIAA2012Q0VF49 1180 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 MTM1Q13496 603 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 NFYCQ13952 458 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 UBE4AQ14139 1066 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 PLS1Q14651 629 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 ZNF568Q3ZCX4 644 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 FAM124AQ86V42 546 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 SHCBP1Q8NEM2 672 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 RABGGTAQ92696 567 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 PMM1Q92871 262 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 LPPQ93052 612 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 SLC35A4Q96G79 324 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 FAM89AQ96GI7 184 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 SAMD11Q96NU1 681 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 MPHOSPH8Q99549 860 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 ENKD1Q9H0I2 346 aa5.85□□□□□ -1.47
CASP4-211ENST00000533252 TMEM60Q9H2L4 133 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77 ms