RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531473.5

TSTA3-214, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSTA3, Length 2,220 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-214ENST00000531473 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 ANK1P16157 1881 aa21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 RARBP10826 455 aa21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 ABCB4P21439 1286 aa21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 ZACNQ401N2 412 aa21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 PALB2Q86YC2 1186 aa21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 BRSK2Q8IWQ3 736 aa21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 C7orf31Q8N865 590 aa21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 SLC35G2Q8TBE7 412 aa21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 SPDL1Q96EA4 605 aa21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 KLHL33A6NCF5 533 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 P4HA2O15460 535 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 HLA-DRAP01903 254 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 KRT71Q3SY84 523 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 OSGEPQ9NPF4 335 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 AMFRQ9UKV5 643 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 LDHAP00338 332 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 TMC3Q7Z5M5 1100 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 HOOK3Q86VS8 718 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 ASGR1P07306 291 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 KCNA10Q16322 511 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 SEC14L1Q92503 715 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 HES6Q96HZ4 224 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 CGRRF1Q99675 332 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 AP1M1Q9BXS5 423 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 FAM114A2Q9NRY5 505 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 HES2Q9Y543 173 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 KRIT1O00522 736 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 PMM2O15305 246 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 POU5F1BQ06416 359 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 FAM187BQ17R55 369 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 KIRREL3Q8IZU9 778 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 RASGEF1CQ8N431 466 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 CCDC26Q8TAB7 109 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 ANKRD33BA6NCL7 494 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 SART1O43290 800 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 CCND1P24385 295 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 PIK3CAP42336 1068 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 AGPAT1Q99943 283 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 NEUROG2Q9H2A3 272 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 SAMD15Q9P1V8 674 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 TRIP11Q15643 1979 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 ANKRD62A6NC57 917 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 CLTAP09496 248 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 STAG3L1P0CL83 205 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 GTF2H1P32780 548 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 RAET1EQ8TD07 263 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 CCDC134Q9H6E4 229 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 CYP26A1O43174 497 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 SGPL1O95470 568 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 NFICP08651 508 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 HOXC8P31273 242 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 ADCY2Q08462 1091 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 ANKRD27Q96NW4 1050 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 THAP2Q9H0W7 228 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 TAS2R14Q9NYV8 317 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-214ENST00000531473 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
TSTA3-214ENST00000531473 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa21.39■■□□□ 1.01
TSTA3-214ENST00000531473 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
TSTA3-214ENST00000531473 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.39■■□□□ 1.01
TSTA3-214ENST00000531473 NT5C1BQ96P26 610 aa21.39■■□□□ 1.01
TSTA3-214ENST00000531473 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
TSTA3-214ENST00000531473 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.39■■□□□ 1.01
TSTA3-214ENST00000531473 LACTBL1A8MY62 500 aa21.39■■□□□ 1.01
TSTA3-214ENST00000531473 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.39■■□□□ 1.01
TSTA3-214ENST00000531473 PPFIA2O75334 1257 aa21.39■■□□□ 1.01
TSTA3-214ENST00000531473 BIRC2Q13490 618 aa21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms