RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 NR4A2P43354 598 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-220ENST00000531466 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRK-220ENST00000531466 HMCESQ96FZ2 354 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-220ENST00000531466 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-220ENST00000531466 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-220ENST00000531466 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
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PTPRK-220ENST00000531466 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
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PTPRK-220ENST00000531466 SLC4A10Q6U841 1118 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRK-220ENST00000531466 MAVSQ7Z434 540 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRK-220ENST00000531466 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-220ENST00000531466 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-220ENST00000531466 ENGP17813 658 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-220ENST00000531466 IARSP41252 1262 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-220ENST00000531466 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-220ENST00000531466 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-220ENST00000531466 Q4G0T1 1027 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-220ENST00000531466 PPP4R3AQ6IN85 833 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-220ENST00000531466 KRT73Q86Y46 540 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-220ENST00000531466 EBF3Q9H4W6 596 aa5.93□□□□□ -1.46
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