RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 LPIN3Q9BQK8 851 aa25.91■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 PLCB2Q00722 1185 aa25.9■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 LRRTM3Q86VH5 581 aa25.9■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 SPEM1Q8N4L4 309 aa25.9■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 ACCSQ96QU6 501 aa25.9■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 IKZF4Q9H2S9 585 aa25.9■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 FRMD3A2A2Y4 597 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 LDHAP00338 332 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 CTHP32929 405 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 CXCL12P48061 93 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 KCNA1Q09470 495 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 RESTQ13127 1097 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 ALCAMQ13740 583 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 GAS6Q14393 721 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 DGKKQ5KSL6 1271 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 BRSK2Q8IWQ3 736 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 BPIFB1Q8TDL5 484 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 GCNAQ96QF7 691 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-211ENST00000531461 OBSL1O75147 1896 aa25.89■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 SLC38A8A6NNN8 435 aa25.88■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 SOBPA7XYQ1 873 aa25.88■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa25.88■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 GARTP22102 1010 aa25.88■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 CLIC6Q96NY7 704 aa25.88■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 PRAMEF12O95522 483 aa25.87■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 SYT1P21579 422 aa25.87■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 SDHBP21912 280 aa25.87■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 SYNPOQ8N3V7 929 aa25.87■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 FAM213AQ9BRX8 229 aa25.87■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 GTSE1Q9NYZ3 720 aa25.87■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa25.87■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 GCNT3O95395 438 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 SOX9P48436 509 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 CYP4F8P98187 520 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 TSPY1Q01534 308 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 SATB1Q01826 763 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 TAF12Q16514 161 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 WDR44Q5JSH3 913 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 TXNDC11Q6PKC3 985 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 CMTM8Q8IZV2 173 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 LRRC52Q8N7C0 313 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 SPATA18Q8TC71 538 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 SLC46A2Q9BY10 475 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 TGM1P22735 817 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 CASP5P51878 434 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 WNT7BP56706 349 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 CCINQ13939 588 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 SLC39A14Q15043 492 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 TMEM150AQ86TG1 271 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 GPIHBP1Q8IV16 184 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 TMEM86AQ8N2M4 240 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 C1orf127Q8N9H9 656 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 CXorf38Q8TB03 319 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 ZFYVE19Q96K21 471 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 ACBD6Q9BR61 282 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 ABCB6Q9NP58 842 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 TBC1D7Q9P0N9 293 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 GMEB2Q9UKD1 530 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa25.84■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 F11P03951 625 aa25.84■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 HOXA6P31267 233 aa25.84■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 CNR2P34972 360 aa25.84■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 ARHGAP8P85298 464 aa25.84■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.84■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.84■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa25.84■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 GIPC2Q8TF65 315 aa25.84■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 TMEM206Q9H813 350 aa25.84■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 TMLHEQ9NVH6 421 aa25.84■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 GDAP2Q9NXN4 497 aa25.84■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 ITGA11Q9UKX5 1188 aa25.84■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 RAB23Q9ULC3 237 aa25.84■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 EXTL3O43909 919 aa25.83■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 ITGB3P05106 788 aa25.83■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 CSH1P0DML2 217 aa25.83■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 CSH2P0DML3 217 aa25.83■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 STAT6P42226 847 aa25.83■■□□□ 1.73
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