RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 STX10O60499 249 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 TACC1O75410 805 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 CLSTN1O94985 981 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 ASS1P00966 412 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM163BP0C2L3 166 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 PCSK1P29120 753 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT39Q6A163 491 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 TAF4BQ92750 862 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 CRISPLD1Q9H336 500 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 POLIQ9UNA4 740 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 YIPF1Q9Y548 306 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 MXI1P50539 228 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 DUSP4Q13115 394 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 USTQ9Y2C2 406 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 TNFRSF10AO00220 468 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 HCRTO43612 131 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 NLRP12P59046 1061 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 TWF1Q12792 350 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC35C1Q96A29 364 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 PKMYT1Q99640 499 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 SYT15Q9BQS2 421 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 CDH9Q9ULB4 789 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 C2CD4DB7Z1M9 353 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 GNA14O95837 355 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 P4HA1P13674 534 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 LMO2P25791 158 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 PLD1Q13393 1074 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 SPOPLQ6IQ16 392 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 MED15Q96RN5 788 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 SNX25Q9H3E2 840 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 NME7Q9Y5B8 376 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 NTHL1P78549 312 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 CBWD6Q4V339 395 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 ELMOD1Q8N336 334 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 CEP72Q9P209 647 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 DACH1Q9UI36 760 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-208ENST00000531226 PDGFRBP09619 1106 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 PTPN2P17706 415 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 FSHRP23945 695 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 ASPAP45381 313 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 RAP1GAPP47736 663 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 ALDH1A3P47895 512 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 CDR1P51861 262 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC142Q17RM4 750 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM171BQ6P995 826 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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