RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528066.1

RCOR3-209, Transcript of REST corepressor 3, human

TSL 3

Gene RCOR3, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCOR3-209	ENST00000528066	HK1	P19367	917 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	AGXT	P21549	392 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	CRHR1	P34998	444 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	TEF	Q10587	303 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	CSRP2	Q16527	193 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	LENG9	Q96B70	501 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	PRRX2	Q99811	253 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	COL6A3	P12111	3177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	ADCY6	O43306	1168 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	PPIP5K2	O43314	1243 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	OSM	P13725	252 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	MCAM	P43121	646 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	SLC5A3	P53794	718 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	MALL	Q13021	153 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	MDM1	Q8TC05	714 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	HAS1	Q92839	578 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	MRC1	P22897	1456 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	NUP98	P52948	1817 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	TAF1	P21675	1872 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	ADM5	C9JUS6	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	WNT10B	O00744	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	RAMP2	O60895	175 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	PTGS2	P35354	604 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	MTMR1	Q13613	665 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	TNIP1	Q15025	636 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	CRY2	Q49AN0	593 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	REPS2	Q8NFH8	660 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	KCNH6	Q9H252	994 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	HTT	P42858	3142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCOR3-209	ENST00000528066	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	ANP32C	O43423	234 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	PROZ	P22891	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	GPT	P24298	496 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	SREBF1	P36956	1147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	FLT3LG	P49771	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCOR3-209	ENST00000528066	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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