RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526715.5

ATG13-208, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-208	ENST00000526715	EPCAM	P16422	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	LHX1	P48742	406 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	KLK7	P49862	253 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	CLCN4	P51793	760 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	FANCC	Q00597	558 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	UBXN1	Q04323	297 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	ORC1	Q13415	861 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	CUL2	Q13617	745 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	RAB33A	Q14088	237 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	RRAGA	Q7L523	313 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	SYT15	Q9BQS2	421 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	TRANK1	O15050	2925 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715		A8MXQ7	604 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	TEX33	O43247	280 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	VNN2	O95498	520 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	PCSK1	P29120	753 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	NDST1	P52848	882 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	TSPY1	Q01534	308 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	INCA1	Q0VD86	236 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	KCNC3	Q14003	757 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	SYCP1	Q15431	976 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	EFHB	Q8N7U6	833 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	WHAMM	Q8TF30	809 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	TWNK	Q96RR1	684 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	PKMYT1	Q99640	499 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	ACBD6	Q9BR61	282 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	PTPRD	P23468	1912 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715		A0A1B0GTH6	734 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	MTMR11	A4FU01	709 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	TBX10	O75333	385 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	CILP	O75339	1184 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	ABLIM3	O94929	683 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	FAM163B	P0C2L3	166 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	GCNT1	Q02742	428 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	GPR17	Q13304	367 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	ZNF394	Q53GI3	561 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	LILRA6	Q6PI73	481 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	ACOT1	Q86TX2	421 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	UBR7	Q8N806	425 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	CISH	Q9NSE2	258 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	CLDND1	Q9NY35	253 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	CDH9	Q9ULB4	789 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-208	ENST00000526715	EPHB6	O15197	1021 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-208	ENST00000526715	SEC24A	O95486	1093 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-208	ENST00000526715	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-208	ENST00000526715	ADCY1	Q08828	1119 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-208	ENST00000526715	ADAM15	Q13444	863 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-208	ENST00000526715	COL19A1	Q14993	1142 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-208	ENST00000526715	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-208	ENST00000526715	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-208	ENST00000526715	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-208	ENST00000526715	UNC93A	Q86WB7	457 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-208	ENST00000526715	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-208	ENST00000526715	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-208	ENST00000526715	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		13.52	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms