RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525725.5

PACSIN3-203, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-203ENST00000525725 TNMDQ9H2S6 317 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 SPAG17Q6Q759 2223 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 ZNF263O14978 683 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 GABRR2P28476 465 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 METTL23Q86XA0 190 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 PKMYT1Q99640 499 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 PANK4Q9NVE7 773 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 SIX4Q9UIU6 781 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 L1RE1Q9UN81 338 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 NCOR2Q9Y618 2525 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 EXTL3O43909 919 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 KINO60870 393 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 ITGB3P05106 788 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 IDEP14735 1019 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 CDC25CP30307 473 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 VEPH1Q14D04 833 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 WDR44Q5JSH3 913 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 SPATA18Q8TC71 538 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 FAM3CQ92520 227 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 FAM84AQ96KN4 292 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 EPC1Q9H2F5 836 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 PTPRJQ12913 1337 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 PPP6R2O75170 966 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 RUBCNQ92622 972 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 TRIM9Q9C026 710 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 CUEDC2Q9H467 287 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 TASP1Q9H6P5 420 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 TMEM206Q9H813 350 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 ABCB6Q9NP58 842 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 YEATS4O95619 227 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 CHRNB1P11230 501 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 HOXD13P35453 343 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 CYP4F8P98187 520 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 GPR158Q5T848 1215 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 PDILTQ8N807 584 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 SPTLC2O15270 562 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 CTHP32929 405 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 FOXK2Q01167 660 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 EHHADHQ08426 723 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 GAS6Q14393 721 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 STK38Q15208 465 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 GPD1LQ8N335 351 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 SNX21Q969T3 373 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 ACBD6Q9BR61 282 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 EML5Q05BV3 1969 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-203ENST00000525725 SPTBN2O15020 2390 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-203ENST00000525725 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-203ENST00000525725 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-203ENST00000525725 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-203ENST00000525725 GABRDO14764 452 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-203ENST00000525725 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-203ENST00000525725 TADA3O75528 432 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-203ENST00000525725 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-203ENST00000525725 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-203ENST00000525725 TSPY1Q01534 308 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-203ENST00000525725 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-203ENST00000525725 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-203ENST00000525725 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-203ENST00000525725 TSSK4Q6SA08 328 aa22.76■■□□□ 1.23
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