RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM49BQ9NUQ9 324 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 CNTN6Q9UQ52 1028 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 SYN3O14994 580 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 SOD2P04179 222 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 PTMAP06454 111 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 CFHP08603 1231 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 CD19P15391 556 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 BRD2P25440 801 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 CA8P35219 290 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 ARPP19P56211 112 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 JAKMIP2Q96AA8 810 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 IQCDQ96DY2 449 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 CHP1Q99653 195 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 CHST7Q9NS84 486 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 DSEQ9UL01 958 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 EPOPA6NHQ4 379 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 GRM6O15303 877 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAM12O43184 909 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 RAB30Q15771 203 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 CTXN3Q4LDR2 81 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRTM3Q86VH5 581 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC28A3Q9HAS3 691 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 AIPL1Q9NZN9 384 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 MYBPHLA2RUH7 354 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 OAZ2O95190 189 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 PAX3P23760 479 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 LHX1P48742 406 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 ERVFC1P60507 584 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 ERVK-21P61565 698 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 PLCB3Q01970 1234 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 SPPL3Q8TCT6 385 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 POF1BQ8WVV4 589 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 TIFAQ96CG3 184 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 CRTAC1Q9NQ79 661 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 GTF3C4Q9UKN8 822 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 RFXAPO00287 272 aa24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP11B1P15538 503 aa24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 HGSNATQ68CP4 663 aa24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 SYT15Q9BQS2 421 aa24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 HAUS4Q9H6D7 363 aa24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 TMLHEQ9NVH6 421 aa24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 MYO6Q9UM54 1294 aa24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC130P13994 396 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 GNA15P30679 374 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 MDH1BQ5I0G3 518 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 THEM5Q8N1Q8 247 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 CLDN5O00501 218 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 GLUD2P49448 558 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PTK2Q05397 1052 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHL30Q0D2K2 578 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 UNC93AQ86WB7 457 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXO22Q8NEZ5 403 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 EPS8L1Q8TE68 723 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PLVAPQ9BX97 442 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 C5orf67F2Z3F1 127 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 THAP12O43422 761 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 FERP16591 822 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 IRS1P35568 1242 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 DSG1Q02413 1049 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 CAMK1Q14012 370 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PSMD5Q16401 504 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 TMC7Q7Z402 723 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 GDPD5Q8WTR4 605 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PGLYRP2Q96PD5 576 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 TCF25Q9BQ70 676 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBP1Q9H171 429 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 RWDD3Q9Y3V2 267 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 KIAA1671Q9BY89 1806 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGEF37A1IGU5 675 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 URODP06132 367 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 MMEP08473 750 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 GPM6BQ13491 265 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PASD1Q8IV76 773 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 ACBD6Q9BR61 282 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 CDY1Q9Y6F8 540 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 CHRNB2P17787 502 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms