RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524131.5

MEG3-223, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MEG3, Length 721 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-223	ENST00000524131	TRIM49C	P0CI26	452 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	ARHGAP25	P42331	645 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	PTEN	P60484	403 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	GNG11	P61952	73 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	CBWD6	Q4V339	395 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF410	Q86VK4	478 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	LMO3	Q8TAP4	145 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	FZD8	Q9H461	694 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	KCNK12	Q9HB15	430 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	VWA8	A3KMH1	1905 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	CEP250	Q9BV73	2442 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	TISP43	B9A030	160 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	CASQ1	P31415	396 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	SOX5	P35711	763 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	ID4	P47928	161 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	RAB27A	P51159	221 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	PPP3CA	Q08209	521 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	KIF5A	Q12840	1032 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	SLC18A3	Q16572	532 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	IQCE	Q6IPM2	695 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	SIX5	Q8N196	739 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	RDH13	Q8NBN7	331 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	RNF149	Q8NC42	400 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	DNAI1	Q9UI46	699 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	INTU	Q9ULD6	942 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	NOTCH4	Q99466	2003 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	KRBA1	A5PL33	1030 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131		F8VZ95	297 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	OGT	O15294	1046 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	CLDN3	O15551	220 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	DDHD2	O94830	711 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	PAPLN	O95428	1278 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	EFEMP2	O95967	443 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	SKI	P12755	728 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	PROZ	P22891	400 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	MFAP3	P55082	362 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	MCL1	Q07820	350 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF592	Q92610	1267 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	SAAL1	Q96ER3	474 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	FNBP1	Q96RU3	617 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	CGRRF1	Q99675	332 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	ANO9	A1A5B4	782 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	DYNC1I1	O14576	645 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	MAGEA1	P43355	309 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MEG3-223	ENST00000524131	GCLM	P48507	274 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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