RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702		H3BUI4	141 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	IRAK2	O43187	625 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	DAPK3	O43293	454 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	FRS3	O43559	492 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ENDOD1	O94919	500 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	IL18RAP	O95256	599 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	KIT	P10721	976 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	PROZ	P22891	400 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CNTF	P26441	200 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT9	P35527	623 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	HSPA7	P48741	367 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	NUCB1	Q02818	461 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	DAG1	Q14118	895 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	POSTN	Q15063	836 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF480	Q8WV37	535 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	MUL1	Q969V5	352 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	MNT	Q99583	582 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A088AWK7	358 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702		A6NCN8	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	MASP2	O00187	686 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	TOX4	O94842	621 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CD4	P01730	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	AMY1A	P04745	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ECHS1	P30084	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	GUCY1A2	P33402	732 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	COPB2	P35606	906 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	SREBF1	P36956	1147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	MPP1	Q00013	466 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67	2e-6	■■■■□ 19.9
FAM49B-222	ENST00000522702	NOG	Q13253	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	DACT1	Q9NYF0	836 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	EYA2	O00167	538 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	WNT10B	O00744	389 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC16A6	O15403	523 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ADCY6	O43306	1168 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	FGF18	O76093	207 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ABHD16A	O95870	558 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ITGB1	P05556	798 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CRHR1	P34998	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	RXRG	P48443	463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP8B2	P98198	1209 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CNGA2	Q16280	664 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ZACN	Q401N2	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT40	Q6A162	431 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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