RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.33□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.33□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.33□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 SPC25Q9HBM1 224 aa6.33□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.33□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.33□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 DKK3Q9UBP4 350 aa6.33□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 POLHQ9Y253 713 aa6.33□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 FZD9O00144 591 aa6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 JTBO76095 146 aa6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 ARIH2O95376 493 aa6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 CHRM3P20309 590 aa6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 KELP23276 732 aa6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 CERS1P27544 350 aa6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 PCSK6P29122 969 aa6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 DSC2Q02487 901 aa6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 ITKQ08881 620 aa6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 MAPK7Q13164 816 aa6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 MTMR1Q13613 665 aa6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 ZNF626Q68DY1 528 aa6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 C3orf20Q8ND61 904 aa6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 MTMR8Q96EF0 704 aa6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 RAD54BQ9Y620 910 aa6.32□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.31□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 VPS4BO75351 444 aa6.31□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 KIF20AO95235 890 aa6.31□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 LATS1O95835 1130 aa6.31□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 PRDX5P30044 214 aa6.31□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 PTGER1P34995 402 aa6.31□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 GUCY2FP51841 1108 aa6.31□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 TUBA4AP68366 448 aa6.31□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 TCF15Q12870 199 aa6.31□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 KIF22Q14807 665 aa6.31□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.31□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.31□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 TBC1D5Q92609 795 aa6.31□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.31□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.3□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 GABRDO14764 452 aa6.3□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 GNAI2P04899 355 aa6.3□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 EPHB2P29323 1055 aa6.3□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 PROSER3Q2NL68 480 aa6.3□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.3□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.3□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 ZNF804AQ7Z570 1209 aa6.3□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 NEK8Q86SG6 692 aa6.3□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.3□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 WDCPQ9H6R7 721 aa6.3□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.3□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.3□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.29□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 TP73O15350 636 aa6.29□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 FAM163BP0C2L3 166 aa6.29□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 JUPP14923 745 aa6.29□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 PHKA1P46020 1223 aa6.29□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 ALDH9A1P49189 494 aa6.29□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.29□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 VPS53Q5VIR6 699 aa6.29□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 MORN5Q5VZ52 161 aa6.29□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.29□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.29□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 MIER2Q8N344 545 aa6.29□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 NELL2Q99435 816 aa6.29□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 M0QYG6 137 aa6.28□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 SLC16A6O15403 523 aa6.28□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.28□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.28□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 USP37Q86T82 979 aa6.28□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 FANCBQ8NB91 859 aa6.28□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 REPS1Q96D71 796 aa6.28□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 SERHLQ9NQF3 203 aa6.28□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.28□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.28□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SGCE-211ENST00000522045 PPM1DO15297 605 aa6.27□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 DTNBO60941 627 aa6.27□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 BMP15O95972 392 aa6.27□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 PDHA1P08559 390 aa6.27□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 ETFDHQ16134 617 aa6.27□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 PTPN21Q16825 1174 aa6.27□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 FCRL4Q96PJ5 515 aa6.27□□□□□ -1.41
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