RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517006.1

RNU6-410P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 410, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-410P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-410P-201ENST00000517006 COL10A1Q03692 680 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-410P-201ENST00000517006 DPTQ07507 201 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-410P-201ENST00000517006 FOXI1Q12951 378 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-410P-201ENST00000517006 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-410P-201ENST00000517006 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
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RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC46A1Q96NT5 459 aa4.14□□□□□ -1.75
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RNU6-410P-201ENST00000517006 RNF220Q5VTB9 566 aa4.13□□□□□ -1.75
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RNU6-410P-201ENST00000517006 SALL3Q9BXA9 1300 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-410P-201ENST00000517006 A0A087X1B8 175 aa4.11□□□□□ -1.75
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RNU6-410P-201ENST00000517006 TMEM233B4DJY2 109 aa4.11□□□□□ -1.75
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RNU6-410P-201ENST00000517006 SOAT2O75908 522 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-410P-201ENST00000517006 ESRRBO95718 433 aa4.11□□□□□ -1.75
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RNU6-410P-201ENST00000517006 THP07101 528 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-410P-201ENST00000517006 MYF5P13349 255 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-410P-201ENST00000517006 BRAFP15056 766 aa4.11□□□□□ -1.75
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