RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515802.5

SH3BP2-229, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,247 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-229ENST00000515802 DNAJC24Q6P3W2 148 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-229ENST00000515802 TMC3Q7Z5M5 1100 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-229ENST00000515802 SAPCD2Q86UD0 394 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-229ENST00000515802 IFNL1Q8IU54 200 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-229ENST00000515802 RHOT1Q8IXI2 618 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-229ENST00000515802 ARL8AQ96BM9 186 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-229ENST00000515802 RUFY1Q96T51 708 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-229ENST00000515802 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-229ENST00000515802 LRRC19Q9H756 370 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-229ENST00000515802 DPP3Q9NY33 737 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-229ENST00000515802 TJP2Q9UDY2 1190 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-229ENST00000515802 RASAL2Q9UJF2 1139 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-229ENST00000515802 USTQ9Y2C2 406 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-229ENST00000515802 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 HAS3O00219 553 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 IGHA2P01877 340 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 FNTAP49354 379 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 BEX3Q00994 111 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 CHADLQ6NUI6 762 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 CATSPER4Q7RTX7 472 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 ERICH1Q86X53 443 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 KATNAL2Q8IYT4 538 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 C1orf54Q8WWF1 131 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 KIF12Q96FN5 646 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 LHX5Q9H2C1 402 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 PSD3Q9NYI0 1048 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 GRHL1Q9NZI5 618 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 IP6K2Q9UHH9 426 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 GJD2Q9UKL4 321 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 SNX24Q9Y343 169 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 OPA1O60313 960 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 DARSP14868 501 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 RPL21P46778 160 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 DRG2P55039 364 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 SGO2Q562F6 1265 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 SLC27A1Q6PCB7 646 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 ZDHHC24Q6UX98 284 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 CCDC105Q8IYK2 499 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 C3orf20Q8ND61 904 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 LRRC45Q96CN5 670 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 FMO2Q99518 471 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 CYP3A43Q9HB55 503 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 SNTG2Q9NY99 539 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 PLAAQ9Y263 795 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 PTPN22Q9Y2R2 807 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 GOLGA6CA6NDK9 693 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 GOLGA8KD6RF30 607 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 MYO1CO00159 1063 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 MED7O43513 233 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 GOLGA6DP0CG33 693 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 GJC1P36383 396 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 PSEN2P49810 448 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 RBP5P82980 135 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 RGMBQ6NW40 437 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 NT5DC4Q86YG4 428 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 TMEM40Q8WWA1 233 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 DNAJB3Q8WWF6 145 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 ATG4AQ8WYN0 398 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 TMEM176AQ96HP8 235 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 SNX27Q96L92 541 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 APBA2Q99767 749 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 CHST7Q9NS84 486 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 HES2Q9Y543 173 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 F8VP50 259 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 PODXLO00592 558 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 TREHO43280 583 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 STAU1O95793 577 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 RALAP11233 206 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 P4HA1P13674 534 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 RGS2P41220 211 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 LMAN1P49257 510 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 CPT1AP50416 773 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 CDC42EP1Q00587 391 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 INCA1Q0VD86 236 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 CCDC50Q8IVM0 306 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 CD302Q8IX05 232 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 CPXM1Q96SM3 734 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 TXLNGYQ9BZA5 131 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 KLHL11Q9NVR0 708 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 H0YGN5 161 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 MYL3P08590 195 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 SLC10A3P09131 477 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 CTGFP29279 349 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 NOTUMQ6P988 496 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 EXD1Q8NHP7 514 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 FBXO25Q8TCJ0 367 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 SLCO2A1Q92959 643 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-229ENST00000515802 RUNDC3BQ96NL0 473 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms